整合单细胞与空间转录组学分析揭示默克尔细胞生成的关键信号通路
该数据集整合了单细胞转录组和空间转录组两种模态的数据，聚焦于默克尔细胞的发育过程，通过分析单细胞水平的基因表达异质性和组织空间背景下的表达模式，鉴定了IGF1R-AKT和FGFR2等关键信号通路在默克尔细胞生成中的调控作用，主要用于皮肤生物学、发育机制以及相关疾病（如默克尔细胞癌）的研究与建模。
基本信息
资源简介
该数据集通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学技术，研究默克尔细胞（Merkel cells, MCs）的发育过程。scRNA-seq提供单细胞水平的基因表达数据，用于识别细胞异质性和不同细胞状态；空间转录组学则保留细胞在组织中的原始空间位置信息，支持在真实组织背景下分析基因表达模式。通过整合这两种互补技术，数据集成功鉴定了与默克尔细胞形成相关的关键信号通路，特别是发现IGF1R可能通过AKT信号通路调控默克尔细胞的生成，并验证了FGFR2信号在默克尔细胞生成中的重要功能。该数据集为深入理解默克尔细胞生物学、皮肤发育机制以及干细胞研究和疾病建模提供了有力的技术基础和数据支持。
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.17933885
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数据说明
该数据集通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学技术，研究默克尔细胞（Merkel cells, MCs）的发育过程。scRNA-seq提供单细胞水平的基因表达数据，用于识别细胞异质性和不同细胞状态；空间转录组学则保留细胞在组织中的原始空间位置信息，支持在真实组织背景下分析基因表达模式。通过整合这两种互补技术，数据集成功鉴定了与默克尔细胞形成相关的关键信号通路，特别是发现IGF1R可能通过AKT信号通路调控默克尔细胞的生成，并验证了FGFR2信号在默克尔细胞生成中的重要功能。该数据集为深入理解默克尔细胞生物学、皮肤发育机制以及干细胞研究和疾病建模提供了有力的技术基础和数据支持。
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