黑色素瘤RNA测序数据集

该数据集是一个包含44对II期至IV期黑色素瘤组织及其癌旁正常组织的RNA测序数据,数据模态为基因表达谱,采集自复旦大学附属肿瘤医院和湘雅医院,主要用于黑色素瘤的分子机制研究、生物标志物发现、肿瘤异质性分析以及潜在治疗靶点的探索。

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黑色素瘤RNA测序
Melanoma_RNAseq

基本信息

大小
0.025849868 GB
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-09-21

资源简介

黑色素瘤RNA测序数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Melanoma_RNAseq》。源站首次发布:2022。

【数据内容】

源站原始描述:We collected 44 stage II to IV melanoma and paired adjacent normal tissues from Fudan University Shanghai Cancer Centre and Xiangya Hospital between May 2018 and September 2020. The median age of the melanoma patients was 62.5 years (range, 11 to 85 years), with 13(30%) male patients and 31 (70%) female patients

【获取与许可】

源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/z87v2pvc8t/1

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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源站:http://doi.org/10.17632/z87v2pvc8t.1

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个用于黑色素瘤研究的RNA测序数据集,包含44个II期至IV期黑色素瘤组织样本及其配对的癌旁正常组织样本。数据采集自复旦大学附属肿瘤医院和湘雅医院,时间跨度为2018年5月至2020年9月。样本覆盖了62.5岁中位年龄(范围11至85岁)的患者,其中男性13例(30%)、女性31例(70%)。该数据集可用于探索黑色素瘤的基因表达特征、生物标志物识别、肿瘤异质性分析以及潜在治疗靶点发现等研究方向。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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