MITF与SOX10招募BRG1定义黑色素细胞谱系调控元件特定构型（RNA-seq）
研究聚焦转录因子 MITF 与 SOX10 招募 BRG1，从而在黑色素细胞谱系中定义特定构型的调控元件。数据可服务于黑色素瘤及皮肤与结缔组织疾病相关的基因表达差异分析，帮助研究者考察 MITF、SOX10、BRG1 在调控元件层面的协同作用（来源 ebi.ac.uk）
基本信息
资源简介
MITF与SOX10招募BRG1定义黑色素细胞谱系调控元件特定构型（RNA-seq）
E-GEOD-61966 是一项以 RNA-seq 为技术手段的表达谱实验数据集，全称为“BRG1 recruitment by transcription factors MITF and SOX10 defines a specific configuration of regulatory elements in the melanocyte lineage (RNA-seq)”。该数据集收录于 Expression Atlas，属于差异表达实验，研究物种为 Homo sapiens。其核心关注点在于转录因子 MITF 与 SOX10 对 BRG1 的招募作用，以及这一过程如何在黑色素细胞谱系中定义特定构型的调控元件。数据集在分类上归入皮肤与结缔组织疾病 / 黑色素瘤方向，可为黑色素瘤及相关皮肤疾病的基因表达差异分析提供数据支持，帮助研究者从调控元件层面考察 MITF、SOX10 与 BRG1 之间的协同关系。
【数据集背景】
该数据集来自黑色素细胞谱系相关研究，主题围绕转录因子 MITF 和 SOX10 对 BRG1 的招募机制展开。BRG1 作为染色质重塑相关因子，其被招募到特定调控元件的过程，被认为与黑色素细胞谱系中调控元件的特定构型有关。数据集以 RNA-seq 为实验手段，属于差异表达实验，旨在从基因表达层面反映上述调控关系。其来源站为 ebi.ac.uk，在站内分类中归属于皮肤与结缔组织疾病 / 黑色素瘤方向，说明该数据与黑色素瘤及皮肤、结缔组织疾病的分子机制研究存在关联。
【数据内容】
该数据集为 Expression Atlas 中的一项差异表达实验，物种为 Homo sapiens，实验类型为 RNA-seq。其主题标签为 Differential，表明数据可用于比较不同条件下的基因表达差异。数据集名称直接指向 BRG1 被 MITF 和 SOX10 招募这一生物学事件，以及该事件在黑色素细胞谱系中定义特定调控元件构型的作用。就数据内容的具体样本数量、分组方式、测序深度、基因数量等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据集的来源站为 ebi.ac.uk，收录于 Expression Atlas，属于该平台中的差异表达实验。源站描述指出，该实验的研究物种为 Homo sapiens，研究主题为 MITF 与 SOX10 招募 BRG1 并在黑色素细胞谱系中定义特定调控元件构型，采用 RNA-seq 方法。关于样本采集地点、采集时间、处理流程、建库方法等具体采集信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可服务于黑色素瘤以及皮肤与结缔组织疾病相关的基因表达差异分析。研究者可利用该数据考察 MITF、SOX10、BRG1 在调控元件层面的协同作用，探索黑色素细胞谱系中调控元件特定构型的形成机制。由于属于差异表达实验，其适用场景包括比较不同实验条件下黑色素细胞谱系相关基因的表达变化，以及围绕 MITF、SOX10 和 BRG1 的调控网络开展分析。具体可支持的分析类型和下游应用方向，源站未提供。
【使用方法】
该数据集为 RNA-seq 差异表达实验，可通过来源站 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas 平台获取。使用时可围绕差异表达结果，结合 MITF、SOX10 与 BRG1 的调控关系进行分析。关于数据下载格式、分析工具、标准化方法、统计阈值等具体使用方式，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas，属于差异表达实验，物种为 Homo sapiens。就数据质量评估指标、批次效应、重复数、覆盖度、验证情况等具体质量信息，源站未提供。使用时应结合实验设计本身的特点加以判断。关于该数据集在样本量、统计效力或适用范围上的限制，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk，收录于 Expression Atlas。关于具体的引用文献、作者列表、许可协议、使用条款及数据再分发要求，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-61966
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
表达图谱实验（差异表达）。物种：智人。转录因子MITF和SOX10招募BRG1，定义了黑素细胞谱系中调控元件的特定构型（RNA-seq）
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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