LymphAtlas

LymphAtlas 是一个包含 220 名淋巴瘤患者 483 次全身 FDG PET/CT 检查的多模态医学影像数据集,整合了 PET 代谢影像与 CT 解剖结构两种模态,主要用于淋巴瘤的精确图像分割、定量分析、早期诊断与临床分期研究,并为基于深度学习的自动分割模型开发和精准医学应用提供高质量、标准化的数据基础。

上海交通大学设计学院, 上海交通大学医学院附属第九人民医院, 复旦大学附属肿瘤医院核医学科上海交通大学设计学院, 上海交通大学医学院附属第九人民医院, 复旦大学附属肿瘤医院核医学科
arXiv
2025-04-29 更新
浏览 15
淋巴瘤医学影像分割

基本信息

创建/更新时间
2025-04-29

资源简介

LymphAtlas 是一个高质量的淋巴瘤多模态分割数据集,由上海交通大学设计学院、上海交通大学医学院附属第九人民医院及复旦大学附属肿瘤医院核医学科合作构建。该数据集整合了全身 FDG PET/CT 检查中的 PET 代谢信息和 CT 解剖结构,包含 220 名淋巴瘤患者(其中 106 名非霍奇金淋巴瘤、42 名霍奇金淋巴瘤)的 483 次检查数据。数据集以 nnUNet 格式构建,经过严格的技术验证,适用于精确的肿瘤分割与定量分析。其主要研究方向包括淋巴瘤的早期诊断、临床分期、个体化治疗以及基于深度学习的自动图像分割,为精准医学提供了重要的多模态影像数据支持。

原始链接

https://github.com/SuperD0122/LymphAtlas-

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使用方式

数据集获取

git clone https://github.com/SuperD0122/LymphAtlas-.git

curl -L -o repo.zip https://github.com/SuperD0122/LymphAtlas-/archive/refs/heads/main.zip
unzip repo.zip

源站 README 摘录(使用方式)

LymphAtlas-

A Multimodal Dataset for Lymphatic Malignancies.
The multimodal dataset is currently not public, it will be shared after the paper is published.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

完整仓库:github.com/SuperD0122/LymphAtlas-

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