Medical Decathlon数据集扩展版

扩展Medical Decathlon数据集,包含122项CT研究,用于结肠和结直肠癌分割,经放射科医师验证。

谢切诺夫第一莫斯科国立医科大学谢切诺夫第一莫斯科国立医科大学
arXiv
2024-07-31 更新
浏览 62
医学影像colon segmentationMedical DecathlonUNetcolon
Medical Decathlon dataset extension

基本信息

模态
医学影像
创建/更新时间
2024-07-31

资源简介

Medical Decathlon数据集扩展版

【一句话概览】

该仓库面向结肠分割论文,基于扩展版 Medical Decathlon 数据集构建。相关标签包括结肠分割、Medical Decathlon、UNet 和结肠。仓库内容围绕结肠分割任务展开,涉及 UNet 模型与 Medical Decathlon 数据集的使用(来源 gitflic.ru)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《MDE_colon_segmentation》。

【数据内容】

源站原始描述:Repository for colon segmentation paper on extended Medical Decathlon dataset

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):扩展医学十项全能数据集上结肠分割论文的存储库

【主题与分类】

主题标签:colon segmentation、Medical Decathlon、UNet、colon。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://gitflic.ru/project/sechenovntc/mde_colon_segmentation

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使用方式

数据集获取

源站:https://gitflic.ru/project/sechenovntc/mde_colon_segmentation

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本数据集扩展了Medical Decathlon数据集,专注于从计算机断层扫描(CT)图像中分割结肠和结直肠癌。包含122项研究,经资深放射科医师验证并按质量分类。主要用于结直肠癌检测的分割算法开发,旨在提高检测质量,简化放射科医师工作,加速疾病诊断。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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