瘢痕疙瘩样本中前50个miRNAs数据集
该数据集包含瘢痕疙瘩样本中通过差异表达分析识别出的3576个lncRNA、1427个miRNA和2555个mRNA的基因表达数据,属于多模态基因组学数据,主要用于构建烧伤后瘢痕疙瘩的ceRNA调控网络,研究关键lncRNA和miRNA在瘢痕疙瘩病理过程中的调控机制,为理解其分子发病机理和发现潜在治疗靶点提供生物信息学基础。
基本信息
资源简介
该数据集是一个专注于烧伤后瘢痕疙瘩(keloids)基因调控机制研究的生物信息学数据集。数据集包含通过差异表达分析识别出的3576个差异表达长链非编码RNA(DELs)、1427个差异表达微小RNA(DEMis)和2555个差异表达信使RNA(DEMs)。研究人员基于这些数据构建了竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,特别关注了包含23个DELs、330个DEMs和8个DEMis的关键子网络。通过R语言clusterProfiler包进行了基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,识别出lnc-WRB、lnc-SCNN1G、LINC00271等关键lncRNA以及hsa-miR-21、hsa-miR-34a、hsa-miR-155等关键miRNA。该数据集主要应用于研究烧伤后瘢痕疙瘩形成的分子机制,探索ceRNA网络在病理过程中的调控作用,为理解瘢痕疙瘩的发病机理和潜在治疗靶点提供生物信息学依据。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
源站:https://figshare.com/articles/dataset/The_top_50_miRNAs_in_keloids_samples_/28764563
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数据说明
该数据集是一个专注于烧伤后瘢痕疙瘩(keloids)基因调控机制研究的生物信息学数据集。数据集包含通过差异表达分析识别出的3576个差异表达长链非编码RNA(DELs)、1427个差异表达微小RNA(DEMis)和2555个差异表达信使RNA(DEMs)。研究人员基于这些数据构建了竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,特别关注了包含23个DELs、330个DEMs和8个DEMis的关键子网络。通过R语言clusterProfiler包进行了基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,识别出lnc-WRB、lnc-SCNN1G、LINC00271等关键lncRNA以及hsa-miR-21、hsa-miR-34a、hsa-miR-155等关键miRNA。该数据集主要应用于研究烧伤后瘢痕疙瘩形成的分子机制,探索ceRNA网络在病理过程中的调控作用,为理解瘢痕疙瘩的发病机理和潜在治疗靶点提供生物信息学依据。
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