215只(LE/Stm x BN)F2大鼠皮肤囊肿数量与基因型数据集
该数据集包含215只F2代大鼠的全基因组106个SNP位点的基因型数据以及每只个体的皮肤囊肿数量,数据模态为基因型表格与临床计数,主要用于构建遗传性皮肤病动物模型、通过QTL定位解析皮肤囊肿形成的遗传机制,并支持良性皮肤肿瘤的遗传学研究。

基本信息
资源简介
215只(LE/Stm x BN)F2大鼠皮肤囊肿数量与基因型数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Cutaneous Cyst Number and Genotype of 215 (LE/Stm x BN) F2 Rats》。源站首次发布:2019-03-08。
【数据内容】
源站原始描述:There is evidence that the development of multiple cutaneous cysts (benign skin tumors) is heritable . Using inbred BN rats susceptible to chemically induced cutaneous cyst development and resistant LE/Stm rats we were able to establish a new animal model for genetic dissection of multiple cyst formation. We used a (LE/Stm x BN)F2 Generation treated with MNU for QTL mapping. The data presented in the table repesent genome-wide genotypes of 106 SNPs for 215 F2 rats. Additionally the number of cut…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 139.32 KB。数据集 DOI:10.17632/gp9k5y2y7k.1。
【获取与许可】
源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/gp9k5y2y7k
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://data.mendeley.com/datasets/gp9k5y2y7k
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含215只(LE/Stm x BN)F2代大鼠的基因组数据及皮肤囊肿数量信息,用于研究多发性皮肤囊肿(良性皮肤肿瘤)的遗传基础。数据来源于一项动物实验研究,通过使用易感品系BN大鼠和抗性品系LE/Stm大鼠杂交,并利用N-亚硝基甲基脲(MNU)处理F2代个体,进行数量性状基因座(QTL)定位分析。数据集包含全基因组106个单核苷酸多态性(SNP)位点的基因型数据,以及每只大鼠的皮肤囊肿计数。该数据集主要用于遗传性皮肤病模型构建、QTL定位及皮肤囊肿形成机制的研究。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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