转谷氨酰胺酶1缺陷皮肤中抗菌和先天防御反应分子特征的激活
该数据集包含基因表达谱、蛋白质阵列和抗菌活性检测等多模态数据，主要涉及转谷氨酰胺酶1缺陷小鼠表皮组织的分子特征分析，揭示了抗菌肽基因和炎症因子的上调现象；其研究方向聚焦于遗传性皮肤病（如先天性鱼鳞病）的分子病理机制，旨在阐明皮肤屏障功能缺陷如何触发先天免疫防御反应，为相关疾病的治疗策略提供实验依据。
基本信息
资源简介
转谷氨酰胺酶1缺陷皮肤中抗菌和先天防御反应分子特征的激活
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Activation of Molecular Signatures for Antimicrobial and Innate Defense Responses in Skin with Transglutaminase 1 Deficiency》。配套论文《Activation of Molecular Signatures for Antimicrobial and Innate Defense Responses in Skin with Transglutaminase 1 Deficiency》发表于 PLOS ONE（2016），DOI：10.1371/journal.pone.0159673。源站首次发布：2016-07-21。
【数据内容】
源站原始描述：Mutations of the transglutaminase 1 gene (TGM1) are a major cause of autosomal recessive congenital ichthyoses (ARCIs) that are associated with defects in skin barrier structure and function. However, the molecular processes induced by the transglutaminase 1 deficiency are not fully understood. The aim of the present study was to uncover those processes by analysis of cutaneous molecular signatures. Gene expression profiles of wild-type and Tgm1–/–epidermis were assessed using microarrays. Gene…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 179.45 KB。S1 Table.DOCX：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，105.80 KB。S2 Table.DOCX：application/vnd.openxmlformats-officedocument.wordprocessingml.document，73.65 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0159673。
【主题与分类】
源站学科分类：Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Immunology。主题标签：CCL、antimicrobial peptide genes、PCR、100A、gene expression profiles、skin barrier structure、Transglutaminase 1 Deficiency Mutations、TGM 1 mutations、GM-CSF、transglutaminase 1 deficiency。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Immunology。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Activation_of_Molecular_Signatures_for_Antimicrobial_and_Innate_Defense_Responses_in_Skin_with_Transglutaminase_1_Deficiency/3884913
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Haneda, Takashi; Imai, Yasutomo; Uchiyama, Ryosuke; Jitsukawa, Orie; Yamanishi, Kiyofumi (2016). Activation of Molecular Signatures for Antimicrobial and Innate Defense Responses in Skin with Transglutaminase 1 Deficiency. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
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按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集是一个基因表达谱数据集，研究转谷氨酰胺酶1基因（TGM1）缺陷对皮肤分子特征的影响。数据集包含野生型和Tgm1-/-小鼠表皮组织的基因表达微阵列数据、定量实时PCR数据、蛋白质阵列数据以及抗菌活性检测结果。数据来源于实验研究，通过分析基因表达谱揭示了TGM1缺陷导致抗菌和先天防御反应相关基因（如Il1b、S100a8、S100a9、Defb14等）的上调，以及炎症因子（如IL-1β、G-CSF、CXCL1等）水平的增加。主要研究方向为遗传性皮肤病（如常染色体隐性先天性鱼鳞病）的分子病理机制、皮肤屏障功能缺陷与免疫防御反应的关系，以及潜在的治疗靶点探索。
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