体内恢复层粘连蛋白5β3在交界性大疱性表皮松解症中的表达和功能
该数据集包含通过基因转导技术恢复交界性大疱性表皮松解症(JEB)患者原代角质形成细胞中层粘连蛋白5β3表达后,在SCID小鼠上再生皮肤组织的实验数据,涵盖蛋白质表达、细胞结构(如半桥粒)和基底膜蛋白分布等多模态信息,主要用于研究基因疗法对遗传性皮肤病的治疗潜力,验证β3恢复能否在体内生成正常皮肤并纠正疾病表型。
基本信息
资源简介
该数据集聚焦于遗传性皮肤病——致死性交界性大疱性表皮松解症(JEB),该病由LAMB3基因突变导致层粘连蛋白5β3(β3)表达缺失引起。数据集通过实验方法,从6名无关JEB患者中获取原代角质形成细胞,利用逆转录病毒载体转导β3基因,并在严重联合免疫缺陷(SCID)小鼠上再生人类皮肤组织。数据内容包括:β3转导后皮肤组织的表达情况、半桥粒形成状态、基底膜带蛋白质(如BPAG2、整合素β4/β1、层粘连蛋白α3/γ2)的分布变化,以及β3阴性对照组的疾病表型对比。数据来源于体外基因治疗和体内组织再生实验,主要研究方向为基因疗法在JEB治疗中的应用潜力,旨在验证通过恢复β3表达可纠正皮肤结构缺陷、生成正常皮肤组织,为遗传性皮肤病的基因治疗提供实验依据。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC33186/
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集聚焦于遗传性皮肤病——致死性交界性大疱性表皮松解症(JEB),该病由LAMB3基因突变导致层粘连蛋白5β3(β3)表达缺失引起。数据集通过实验方法,从6名无关JEB患者中获取原代角质形成细胞,利用逆转录病毒载体转导β3基因,并在严重联合免疫缺陷(SCID)小鼠上再生人类皮肤组织。数据内容包括:β3转导后皮肤组织的表达情况、半桥粒形成状态、基底膜带蛋白质(如BPAG2、整合素β4/β1、层粘连蛋白α3/γ2)的分布变化,以及β3阴性对照组的疾病表型对比。数据来源于体外基因治疗和体内组织再生实验,主要研究方向为基因疗法在JEB治疗中的应用潜力,旨在验证通过恢复β3表达可纠正皮肤结构缺陷、生成正常皮肤组织,为遗传性皮肤病的基因治疗提供实验依据。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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