揭示自身反应组：基于蛋白质组学的免疫学指纹图谱揭示浆细胞耗竭疗法的潜力
该数据集是一个基于PhIP-Seq技术的蛋白质组学数据集，包含人类血清样本中针对全蛋白质组肽段文库的自身抗体反应数据，涵盖健康对照、纵向样本及接受不同免疫治疗患者的样本。数据模态主要为基因水平的原始测序读数和相对于模拟免疫沉淀信号的折叠变化数据。该数据集主要用于研究个体独特的“自身反应组”免疫学指纹的稳定性，评估浆细胞耗竭疗法（如抗BCMA CAR-T疗法）对自身抗体谱的调控效果，为自身免疫性疾病的机制研究和治疗策略开发提供重要资源。
基本信息
资源简介
揭示自身反应组：基于蛋白质组学的免疫学指纹图谱揭示浆细胞耗竭疗法的潜力
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Unveiling the autoreactome: Proteome-wide immunological fingerprints reveal the promise of plasma cell depleting therapy》。
【数据内容】
源站原始描述：The prevalence and burden of autoimmune and autoantibody mediated disease continues to rise, yet the etiologies of many of these diseases remain unclear. Despite numerous new targeted immunomodulatory therapies, comprehensive approaches to apply and evaluate the effects of these treatments longitudinally are lacking. Here, we leverage advances in PhIPseq methodology to explore the modulation, or lack thereof, for autoreactive antibodies proteome-wide in both health and disease. We demonstrate th…
【主题与分类】
主题标签：BCMA、Autoimmunity、Autoreactome、PhIP-Seq、CAR-T。
【获取与许可】
源站页面：https://search.dataone.org/view/sha256:ed67157b298f7e696209c4f1ce690a7f8336bc4dfe22b87c2629e1433dea7882
下载信息
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使用方式
数据集获取
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集旨在研究自身免疫性疾病中自身抗体反应的全面特征。数据集包含通过PhIP-Seq技术获取的蛋白质组学数据，涵盖79名健康对照者、7名个体的纵向健康样本、接受IVIG治疗前后的4组样本，以及接受利妥昔单抗治疗的32个样本。数据来源于人类血清样本，通过噬菌体展示文库（包含731,724个独特肽段）进行免疫沉淀测序获得。主要研究方向包括揭示个体独特的“自身反应组”免疫学指纹、评估不同免疫疗法（如抗BCMA CAR-T疗法）对自身抗体谱的影响，以及探索自身免疫性疾病的发病机制和治疗效果评估。
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