HODxOTII小鼠模型自身免疫性溶血性贫血(AIHA)中耐受性红细胞自身反应性CD4 T细胞的RNAseq数据

该数据集提供了基于HODxOTII小鼠模型的RNA测序数据,包含从自身免疫性溶血性贫血模型小鼠脾脏中分选的CD4+ T细胞的转录组信息,数据模态为基因表达谱(RNAseq),主要用于研究红细胞自身反应性T细胞的耐受性机制,探索自身免疫性溶血性贫血发生发展中免疫耐受相关的关键基因和通路,为自身免疫疾病的分子机制研究提供重要资源。

DataONE
2024-07-24 更新
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自身免疫性溶血性贫血T细胞耐受性

基本信息

创建/更新时间
2024-07-24

资源简介

该数据集是基于HODxOTII小鼠模型(自身免疫性溶血性贫血模型)的RNA测序数据,旨在研究红细胞(RBC)特异性自身反应性CD4 T细胞的耐受性相关转录组特征。数据集包含从10-12周龄HOD+OTII+(具有红细胞自身反应性)和对照HOD-OTII+小鼠脾脏中分选的CD4+ T细胞的RNAseq数据,共8个样本(每组4个),每个样本进行双端测序。数据通过Illumina HiSeq平台生成,经过Bowtie2比对、RSEM基因表达量估计、edgeR差异表达分析以及GO和通路富集分析。该数据集主要用于探索T细胞耐受性在自身免疫性溶血性贫血发生发展中的分子机制,为自身免疫疾病的免疫耐受研究提供转录组层面的资源。

原始链接

https://search.dataone.org/view/sha256:439876c6a15ee88c4658790255a3f79c9036daf3032a6c58f31bf9cf4eb17c98

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    • ModelScope: pip install modelscopemodelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

该数据集是基于HODxOTII小鼠模型(自身免疫性溶血性贫血模型)的RNA测序数据,旨在研究红细胞(RBC)特异性自身反应性CD4 T细胞的耐受性相关转录组特征。数据集包含从10-12周龄HOD+OTII+(具有红细胞自身反应性)和对照HOD-OTII+小鼠脾脏中分选的CD4+ T细胞的RNAseq数据,共8个样本(每组4个),每个样本进行双端测序。数据通过Illumina HiSeq平台生成,经过Bowtie2比对、RSEM基因表达量估计、edgeR差异表达分析以及GO和通路富集分析。该数据集主要用于探索T细胞耐受性在自身免疫性溶血性贫血发生发展中的分子机制,为自身免疫疾病的免疫耐受研究提供转录组层面的资源。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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