人喉表皮样癌细胞图像分类数据集
该数据集是一个包含荧光染色的HEp-2细胞显微镜图像的医学图像数据集,数据模态为图像,主要用于抗核抗体模式分类任务,以支持自身免疫性疾病的自动化诊断算法研发和医学图像分析技术的研究。
基本信息
资源简介
HEp-2(人喉表皮样癌细胞)数据集是医学图像分析领域广泛使用的基准数据集,主要用于抗核抗体(ANA)模式分类任务。该数据集包含经荧光染色的HEp-2细胞的显微镜图像,展示了与多种自身免疫性疾病相关的自抗体结合模式。数据来源为实验室采集的细胞图像,通过标准化染色和成像流程构建。该数据集主要用于开发和评估自动化ANA模式识别算法,以辅助自身免疫性疾病的诊断,并推动医学图像分析技术的发展。
下载信息
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使用方式
数据集获取(ModelScope)
方式一:MsDataset(Python)
# 前置依赖: pip install modelscope
from modelscope.msdatasets import MsDataset
ds = MsDataset.load("Genius-Society/HEp2", subset_name="default", split="train")
print(ds)
方式二:CLI(命令行)
pip install modelscope
modelscope download dataset Genius-Society/HEp2
数据集卡片摘录(源站)
简介
HEp-2 (Human Epithelial type 2) 数据集是医学图像分析领域中广泛使用的基准数据集,尤其是用于抗核抗体 (ANA) 模式分类任务。该数据集包含了用荧光染色的 HEp-2 细胞的显微镜图像,展示了与各种自身免疫性疾病相关的自抗体结合的多种模式。研究人员和从业者利用 HEp-2 数据集来开发和评估用于自动化 ANA 模式识别的算法,从而帮助诊断自身免疫性疾病。该数据集中错综复杂的模式考验了计算模型的鲁棒性,使其成为推动自身免疫性疾病理解和先进医学图像分析技术发展的宝贵资源。
数据结构
| 图像 | 6分类标签 |
|---|---|
| .png | 0 着丝粒 / 1 高尔基体 / 2 同质 / 3 记忆体 / 4 核仁 / 5 斑核 |
数据预览
https://www.modelscope.cn/datasets/Genius-Society/HEp2/dataPeview
使用
:modelscope-code[]
维护
跳过大文件
GIT_LFS_SKIP_SMUDGE=1
:modelscope-code[]
镜像
https://huggingface.co/datasets/Genius-Society/HEp2
致谢
- Chapter III - Classifying Cell Images Using Deep Learning Models
- HEp-2 Cell Image Classification with Deep Convolutional Neural Networks
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许可
MIT License
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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