PRJNA1114663：痤疮患者非皮损皮肤转录组
该数据集来自 NCBI，包含痤疮患者非皮损皮肤与健康对照的 RNA-seq 转录组数据。样本取自 49 名轻度痤疮患者上背部非皮损区域（距活动性皮损至少 5 cm）的 4 mm 全层皮肤活检，以及 19 名无痤疮病史的健康对照
基本信息
资源简介
PRJNA1114663：痤疮患者非皮损皮肤转录组
PRJNA1114663 数据集聚焦于痤疮患者非皮损皮肤的转录组特征，来自 NCBI 公共数据资源，归类于皮肤与结缔组织疾病中的痤疮方向。该研究采用 RNA-seq 技术，对轻度痤疮患者上背部远离活动性皮损区域的皮肤活检样本与无痤疮病史健康对照的皮肤样本进行转录组测序，主题标签为原始序列读段（Raw sequence reads）。数据集的核心价值在于提供痤疮患者“外观正常”皮肤在转录层面的分子信息，有助于研究者比较非皮损区域与健康皮肤之间的基因表达差异，从而探索痤疮发生发展中看似未受累皮肤是否存在潜在的转录组改变。整体而言，该数据集以测序原始读段为主要内容，配套样本来源与分组信息明确，适合用于皮肤转录组分析及相关疾病机制研究。
【数据集背景】
痤疮是一种常见的皮肤与结缔组织疾病，既往研究多关注活动性皮损区域，而对非皮损皮肤是否已存在分子层面的改变关注相对有限。该研究以 RNA-seq 为手段，旨在深入了解痤疮患者非皮损皮肤的转录组特征。研究设计纳入了轻度痤疮患者与无痤疮病史的健康对照，通过对上背部全层皮肤活检样本进行转录组测序，为比较两类人群非皮损皮肤的基因表达谱提供数据基础。数据集所属分类为皮肤与结缔组织疾病 / 痤疮，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，即原始序列读段，属于 RNA-seq 转录组测序数据。数据覆盖两类样本：49 名轻度痤疮患者的非皮损皮肤样本，以及 19 名无痤疮病史的健康对照皮肤样本。源站描述未提供具体的测序平台、读长、数据量、基因表达矩阵或差异表达分析结果等信息，相关内容源站未提供。
【采集与来源】
样本采集自研究对象上背部的 4 mm 全层皮肤活检组织。对于痤疮患者，活检部位位于非皮损区域，且距任何活动性皮损至少 5 cm，以尽量排除皮损局部炎症对转录组信号的干扰。健康对照为无痤疮病史的个体。研究从上述活检组织中分离 RNA，并用于 RNA-seq 测序。样本分组与采集部位信息明确，但源站未提供更详细的入组标准、年龄性别构成、取材时间或伦理审批信息。
【适用场景】
该数据集适用于皮肤转录组相关研究，尤其是围绕痤疮非皮损皮肤的基因表达特征分析。可用于比较轻度痤疮患者非皮损皮肤与健康对照皮肤之间的转录组差异，探索痤疮患者外观正常皮肤中可能存在的分子改变；也可作为皮肤疾病转录组研究的参考数据，用于方法学比较、候选基因筛选或通路层面的探索性分析。由于数据为原始序列读段，适合具备 RNA-seq 数据处理能力的科研人员使用。
【使用方法】
使用该数据集通常需要先获取原始序列读段，随后进行质量控制、比对或定量等标准转录组分析流程，并结合样本分组信息开展组间比较。由于源站未提供预处理表达矩阵或分析流程说明，使用者需自行完成从原始读段到表达定量的处理步骤。分析时应严格区分痤疮患者非皮损样本与健康对照样本，并注意样本来源部位为上背部全层皮肤活检，以保证比较的科学性。
【质量与限制】
该数据集的样本分组和采集部位描述较为明确，患者活检均距活动性皮损至少 5 cm，有助于减少皮损局部信号的影响。但源站未提供测序深度、数据质量评估、批次信息、年龄性别等协变量信息，也未提供差异表达分析结果。此外，研究聚焦于轻度痤疮患者的非皮损皮肤，结论外推到中重度痤疮或其他部位皮肤时需谨慎。相关质量指标与限制条件源站未提供更多细节。
【引用与许可】
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为 PRJNA1114663: Transcriptome of non-lesional skin from individuals with acne vulgaris。源站未提供具体的引用文献、作者列表、许可协议或数据使用条款，相关内容源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前，应自行查阅源站页面以获取最新的引用与许可信息。
下载信息
注册下载
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1114663
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究采用RNA-seq技术，旨在深入探究寻常痤疮（acne）患者非病变皮肤的转录组特征。研究人员从49名轻度痤疮患者的上背部采集了4毫米全层皮肤活检样本（活检位置距任何活动性病灶至少5厘米），并从中提取RNA；同时，也收集了19名无痤疮病史的健康对照者的样本进行对比分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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