蒙哥马利结核胸片数据集
蒙哥马利数据集包含肺结核和正常胸片,并提供肺野分割掩膜,常用于结核病影像分类、肺分割和算法验证。 数据包含真实病例或专家标注信息,适用于围绕相关疾病开展模型训练、表型抽取、影像识别、分割、预后评估或临床自然语言处理等研究。

基本信息
资源简介
蒙哥马利结核胸片数据集
【一句话概览】
该软件源自Candemir等人2014年发表于IEEE Trans Med Imaging的论文,用于在胸部X光片上进行肺部分割。软件包含LungSegment_module.m、患者X光片文件夹、模型X光片文件夹、预计算轮廓文件Model_h.mat与Model_v.mat、测试函数TEST.m及多个子函数,并采用SIFT Flow相关函数。系统基于MATLAB 8.4、64位Intel架构、Windows 7开发。使用时将X光片放入患者文件夹并运行TEST.m,即可生成与原始图像同尺寸的二值肺掩膜,可调整参数优化结果(来源 lhncbc.nlm.nih.gov)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Tuberculosis Chest X-ray Image Data Sets》。
【数据内容】
源站原始描述:We present to you software developed as part of the following article: Candemir S, Jaeger S, Palaniappan K, Musco JP, Singh RK, Xue Z, Karargyris A, Antani S, Thoma G, McDonald CJ. Lung segmentation in chest radiographs using anatomical atlases with nonrigid registration. IEEE Trans Med Imaging. 2014 Feb; 33(2):577-90. doi: 10.1109/TMI.2013.2290491 . PMID: 24239990 We request that you cite the paper if this code is used for publications or product. The software contains the following assets: - L…
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):我们向您展示作为以下文章一部分开发的软件:Candemir S, Jaeger S, Palaniappan K, Musco JP, Singh RK, Xue Z, Karargyris A, Antani S, Thoma G, McDonald CJ. 使用非刚性配准的解剖图谱在胸部X射线图像中的肺部分割。IEEE Trans Med Imaging. 2014年2月;33(2):577-90。doi: 10.1109/TMI.2013.2290491。PMID: 24239990。如果此代码用于出版物或产品,我们请求您引用该论文。该软件包含以下资产:- LungSegment_module.m:在CXRs上执行肺部分割。- Patient_Xrays:文件夹包含待分割的患者X射线图像。请将您的测试X射线图像放在此文件夹中。X射线图像可以是DICOM、TIFF、PNG、BMP或JPEG文件格式。- Model_Xrays:文件夹包含示例X射线图像、它们对应的肺部掩模、垂直和水平轮廓。这些X射线图像和肺部掩模在配准过程中使用。- Model_h.mat和Model_v.mat:模型X射线图像的预计算轮廓。- TEST.m:要测试系统,请运行此函数。- 子函数:CEB_polygionCurveEvolution.m, cebShape2Spline.m, f_removeBlackBorderds.m, f_RemoveSmallSegments.m, FindSimilarCXR.m, fitSpline.m, read_Xray.m, read_Xray.m, read_X_Mask.m, RegisterModel.m, SmoothBoundary.m(请参阅这些函数的代码注释。)该系统是在64位Intel架构上运行Windows 7操作系统的MATLAB版…
【主题与分类】
主题标签:Tuberculosis、Chest X-ray、Lung Segmentation、Radiography、MATLAB。
【适用方向】
影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。
【获取与许可】
源站页面:https://lhncbc.nlm.nih.gov/LHC-publications/pubs/TuberculosisChestXrayImageDataSets.html
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://lhncbc.nlm.nih.gov/LHC-publications/pubs/TuberculosisChestXrayImageDataSets.html
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 0.20 GB。
数据说明
蒙哥马利数据集包含肺结核和正常胸片,并提供肺野分割掩膜,常用于结核病影像分类、肺分割和算法验证。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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