烟曲霉分泌组改变铜绿假单胞菌蛋白质组以促进细菌生长：对共感染的意义

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD015056

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数据说明

囊性纤维化患者的呼吸道长期被多种微生物病原体定植，其组成在整个生命过程中不断变化。微生物间相互作用及病原体-宿主相互作用所引起的肺部环境改变，影响了能够建立持续感染的微生物类型。机会性细菌病原体铜绿假单胞菌是囊性纤维化患者发病和死亡的主要原因，据估计，60%至80%的囊性纤维化患者在20岁前会经历铜绿假单胞菌慢性感染。烟曲霉是从囊性纤维化呼吸道中分离出的最常见真菌病原体，影响高达58%的患者。它是过敏性支气管肺曲霉病（ABPA）的致病因子，这是一种因吸入真菌分生孢子而引起的超敏反应性疾病。尽管铜绿假单胞菌和烟曲霉在囊性纤维化呼吸道中的共同定植较为罕见（3.1%至15.8%），但两者同时存在时疾病预后较差。然而，序贯感染更为常见。近期有研究提示，烟曲霉……

由于用于检测烟曲霉的培养方法存在不一致性，最初报道称烟曲霉在青少年囊性纤维化患者中更为流行。尽管烟曲霉具有流行性和持续性，铜绿假单胞菌仍是囊性纤维化肺部的主要病原体，这提示与其他病原体（如烟曲霉）的相互作用可能通过改变铜绿假单胞菌的毒力来影响其致病性。本文报道了一项研究，通过在烟曲霉存在的情况下培养铜绿假单胞菌，测定细菌生长速率和整体蛋白质组的差异，来探究其影响。研究假设烟曲霉创造了一种环境，促进铜绿假单胞菌代谢驱动的增长，从而使其在竞争中胜过真菌。这种增殖增加的分子基础

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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