CBTN儿科脑肿瘤MRI数据
颅咽管瘤属于儿童鞍上脑肿瘤,该数据集提供大规模儿童脑肿瘤MRI资源,可用于影像分类、分割和纵向随访方法开发。

基本信息
资源简介
CBTN儿科脑肿瘤MRI数据
【一句话概览】
儿童脑肿瘤网络(CBTN)为研究人员提供儿童脑肿瘤研究资源,包括儿童脑肿瘤图谱临床数据、多组学数据集、影像数据、临床前模型及数千份高质量生物样本,涵盖多种肿瘤类型。数据获取遵循NIH指南,生物样本和临床前模型的项目申请须经CBTN科学委员会审查批准,审查采用初审和复审,为期四周。受控多组学数据可通过dbGaP申请。数据类型包括临床数据、胚系WGS、体细胞WGS、甲基化、RNASeq、蛋白质组学和影像(来源 cbtn.org)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Platforms - Children''s Brain Tumor Network》。
【数据内容】
源站原始描述:Empowering Discovery Through Data Access CBTN Research Resources for Pediatric Brain Tumor Discovery Data, Specimens, Imaging, and Preclinical Models CBTN provides researchers with one of the most comprehensive pediatric brain tumor research resources available, including Pediatric Brain Tumor Atlas (PBTA) clinical data, multiomic datasets, imaging data, preclinical models, and thousands of high-quality biospecimens spanning diverse tumor types. Access follows NIH guidelines. Project requests ar…
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):通过数据访问赋能发现:CBTN儿科脑肿瘤发现研究资源——数据、标本、影像与临床前模型 CBTN为研究人员提供目前最全面的儿科脑肿瘤研究资源之一,包括儿科脑肿瘤图谱(PBTA)临床数据、多组学数据集、影像数据、临床前模型,以及涵盖多种肿瘤类型的数千份高质量生物标本。数据访问遵循NIH指南。针对生物标本和临床前模型的项目申请须经CBTN科学委员会审查和批准,以确保科学价值和伦理使用。CBTN科学审查流程采用初审和复审,为期四周。在此期间,CBTN团队将与研究者合作,解答任何问题。受控访问的多组学数据也可通过dbGaP申请。 CBTN数据类型 临床数据 胚系WGS 体细胞WGS 甲基化 RNASeq 蛋白质组学 影像 有问题?在此获取帮助。 快速开始! 1 提交申请 填写研究资源访问申请表,供CBTN科学委员会审查。 提交申请 2 确定资源 与CBTN专家合作,确定您需要的标本、模型或其他资源。 3 接收材料 对于非营利机构,材料免费送达您的实验室。 4 建立联系 通过办公时间、工作组等与CBTN研究社区建立联系。 为您的科研加速 CBTN为研究人员连接推动其工作向前发展的机会,从与Gabriella Miller Kids First儿科研究计划(CBTN的基因组数据之家)相关的NIH资助,到通过CBTN Fellowship Program为新研究人员提供的合作机会。 资助机会 奖学金机会 了解推动进展的平台 开放获取 PedcBioPortal共享经过处理的数据,使研究人员能够可视化、探索和分析大规模儿科癌症基因组数据集。无需许可。 PedcBioPortal 开放获取 CBTN蛋白质组学数据可通过CPTAC蛋白质组学数据共享平台(PDC)获取。访问需要dbGaP授权。 CPTAC蛋白质组学数据共享平台 受控访问 dbGaP是由NIH资助的存储库,用于分发探索基因型-表型…
【主题与分类】
主题标签:pediatric brain tumor、clinical data、germline WGS、somatic WGS、methylation、RNASeq、proteomics、imaging、multiomic、preclinical models。
【适用方向】
影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。
【获取与许可】
源站页面:https://cbtn.org/research/platforms/
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://cbtn.org/research/platforms/
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
儿童脑肿瘤网络多机构临床MRI数据,包含多参数纵向MRI和临床信息。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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