模拟上皮性肺损伤的柔性AAV-DTR/DT急性细胞删除小鼠模型肺组织蛋白质组变化的空间分辨率

Eva Griesser,模拟上皮性肺损伤的柔性AAV-DTR/DT急性细胞删除小鼠模型肺组织蛋白质组变化的空间分辨率[数据集]

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蛋白质肺组织蛋白质组学空间分辨率急性细胞删除AAV-DTR/DT模型上皮性肺损伤小鼠模型
蛋白质Spatial resolution of proteomic changes in lung tissue from a flexible AAV-DTR/DT mouse model of acute cell deletion mimicking epithelial lung injury

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

模拟上皮性肺损伤的柔性AAV-DTR/DT急性细胞删除小鼠模型肺组织蛋白质组变化的空间分辨率

该数据集英文名称为“Spatial resolution of proteomic changes in lung tissue from a flexible AAV-DTR/DT mouse model of acute cell deletion mimicking epithelial lung injury”,由Eva Griesser贡献,来源站为ebi.ac.uk。数据集围绕模拟上皮性肺损伤的柔性AAV-DTR/DT急性细胞删除小鼠模型,聚焦肺组织蛋白质组变化的空间分辨率,属于呼吸系统疾病/其他分类。该数据集为蛋白质组学研究提供了与急性细胞删除和上皮性肺损伤相关的肺组织样本数据资源,可供相关领域研究者检索与使用。

【数据集背景】

该数据集来源于ebi.ac.uk,英文标题为“Spatial resolution of proteomic changes in lung tissue from a flexible AAV-DTR/DT mouse model of acute cell deletion mimicking epithelial lung injury”。从标题可知,其研究背景涉及一种柔性AAV-DTR/DT小鼠模型,该模型用于实现急性细胞删除,并模拟上皮性肺损伤。数据集旨在刻画该模型肺组织中蛋白质组变化的空间分辨率。源站描述中标注贡献者为Eva Griesser,并给出了该数据集在PRIDE归档中的项目地址。除上述信息外,关于该模型的具体构建方式、实验设计细节与生物学背景,源站未提供。

【数据内容】

依据数据集名称与源站描述,数据内容涉及小鼠肺组织的蛋白质组变化,并强调空间分辨率这一维度,即关注蛋白质组改变在肺组织空间层面上的分布特征。数据集所属分类为呼吸系统疾病/其他。关于样本数量、蛋白质鉴定数量、定量指标、空间分辨率的具体尺度、数据文件类型与目录结构等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自ebi.ac.uk,源站描述中给出的引用信息为Eva Griesser的数据集条目,并附有PRIDE归档项目链接(https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD025712)。数据与模拟上皮性肺损伤的柔性AAV-DTR/DT急性细胞删除小鼠模型相关。关于样本采集流程、质谱平台、色谱条件、数据处理软件与版本等采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于呼吸系统疾病相关研究,尤其是围绕上皮性肺损伤、急性细胞删除小鼠模型以及肺组织蛋白质组空间变化的研究场景。研究者可将其用于检索和参考该模型下肺组织蛋白质组变化的空间分辨率相关信息。关于具体的分析应用方向与验证用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过源站描述中给出的PRIDE归档项目地址进行访问。关于数据下载方式、文件格式说明、使用许可范围以及分析流程建议,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为来源站ebi.ac.uk收录的数据集条目,其质量评估信息、数据完整性说明与已知技术限制,源站未提供。使用时应注意,该数据集针对特定小鼠模型与特定研究问题,相关结论的外推范围需结合原始研究设计判断,而原始研究设计细节源站未提供。

【引用与许可】

引用信息可参考源站描述:Eva Griesser, Spatial resolution of proteomic changes in lung tissue from a flexible AAV-DTR/DT mouse model of acute cell deletion mimicking epithelial lung injury [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD025712。关于该数据集的许可条款与使用限制,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD025712

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Eva Griesser, Spatial resolution of proteomic changes in lung tissue from a flexible AAV-DTR/DT mouse model of acute cell deletion mimicking epithelial lung injury [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD025712

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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