基于串联质量标签定量蛋白质组学的儿童阻塞性睡眠呼吸暂停血清蛋白质组分析
Dongcai Li,基于串联质量标签的定量蛋白质组学在儿童阻塞性睡眠呼吸暂停中的血清蛋白质组分析 [数据集]。主题标签:儿童阻塞性睡眠呼吸暂停、血清蛋白质组、串联质量标签、定量蛋白质组学、呼吸道疾病

基本信息
资源简介
基于串联质量标签定量蛋白质组学的儿童阻塞性睡眠呼吸暂停血清蛋白质组分析
该数据集英文名为“Serum proteomic analysis by tandem mass tags-based quantitative proteomics in pediatric obstructive sleep apnea”,由Dongcai Li 提交,主题聚焦于儿童阻塞性睡眠呼吸暂停(pediatric obstructive sleep apnea)的血清蛋白质组研究,采用串联质量标签(tandem mass tags,TMT)为基础的定量蛋白质组学技术开展血清蛋白质组分析。数据集来源站为 ebi.ac.uk,在站内分类中归入呼吸道疾病 / 其他类别。数据集的主题标签包括儿童阻塞性睡眠呼吸暂停、血清蛋白质组、串联质量标签、定量蛋白质组学与呼吸道疾病,整体定位是一项面向儿童阻塞性睡眠呼吸暂停的血清蛋白质组定量分析数据集。
【数据集背景】
该数据集围绕儿童阻塞性睡眠呼吸暂停这一呼吸道疾病主题展开。儿童阻塞性睡眠呼吸暂停属于呼吸道疾病范畴,数据集以血清为分析对象,借助串联质量标签为基础的定量蛋白质组学方法开展血清蛋白质组分析,旨在从蛋白质组层面呈现与该疾病相关的血清蛋白质组信息。数据集由 Dongcai Li 提交,来源站为 ebi.ac.uk。
【数据内容】
数据集内容为基于串联质量标签的定量蛋白质组学在儿童阻塞性睡眠呼吸暂停中的血清蛋白质组分析数据。其主题标签涵盖儿童阻塞性睡眠呼吸暂停、血清蛋白质组、串联质量标签、定量蛋白质组学与呼吸道疾病,表明数据内容与血清蛋白质组的定量分析相关。关于具体样本数量、蛋白质鉴定数量、差异表达蛋白列表等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源站为 ebi.ac.uk,源站描述为“Dongcai Li, Serum proteomic analysis by tandem mass tags-based quantitative proteomics in pediatric obstructive sleep apnea [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD032734”。数据集由 Dongcai Li 提交。关于样本采集流程、实验设计、仪器平台与试剂信息等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与儿童阻塞性睡眠呼吸暂停相关的血清蛋白质组研究场景,以及基于串联质量标签的定量蛋白质组学分析场景;也可作为呼吸道疾病领域中血清蛋白质组定量数据的参考。关于具体的适用分析类型与方法学扩展,源站未提供。
【使用方法】
数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 获取,源站描述中给出了数据集访问地址 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD032734。关于数据文件格式、下载方式与具体分析流程,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为基于串联质量标签的定量蛋白质组学血清蛋白质组分析数据集,其质量评估信息、数据完整性说明与使用限制,源站未提供。
【引用与许可】
引用信息可参考源站描述:“Dongcai Li, Serum proteomic analysis by tandem mass tags-based quantitative proteomics in pediatric obstructive sleep apnea [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD032734”。关于数据集的许可条款,源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD032734
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Dongcai Li, Serum proteomic analysis by tandem mass tags-based quantitative proteomics in pediatric obstructive sleep apnea [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD032734
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




