复发性喘息婴儿与异物吸入对照婴儿支气管肺泡灌洗16S rRNA基因测序数据集
该数据集包含复发性喘息婴儿与异物吸入对照婴儿的支气管肺泡灌洗样本16S rRNA基因测序数据,通过基因测序技术获取细菌微生物群组成信息,用于分析不同组别婴儿在细菌多样性、群落结构和预测功能通路方面的差异,旨在探索呼吸道微生物群与婴儿复发性喘息疾病之间的关联,为儿科呼吸道疾病的微生物机制研究和潜在生物标志物发现提供分子层面的数据基础。

基本信息
资源简介
复发性喘息婴儿与异物吸入对照婴儿支气管肺泡灌洗16S rRNA基因测序数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《16S rRNA gene sequencing data of BAL in recurrent wheezing infants and foreign body aspiration control infants》。源站首次发布:2023-02-09。
【数据内容】
源站原始描述:Objectives: Exploring the bronchial bacterial microbiota of infants with recurrent wheezing that differ from foreign body aspiration controls, and the recurrent wheezing infants with atopy that differ from that without atopy to reveal the interactions between recurrent wheezing disease and bronchial bacterial microbiota. Methods: Bacterial communities in bronchoalveolar lavage (BAL) samples from15 atopic wheezing infants, 15 non-atopic wheezing infants, and 18 foreign body aspiration control inf…
【数据结构与技术规格】
文件数 3 个,合计 2.32 GB。数据集 DOI:10.17632/d4kb7zy533.1。
【获取与许可】
源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/d4kb7zy533
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://data.mendeley.com/datasets/d4kb7zy533
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集是基于16S rRNA基因测序技术的支气管肺泡灌洗(BAL)样本微生物组数据集,旨在研究婴儿复发性喘息与支气管细菌微生物群的关联。数据集包含三组婴儿的BAL样本:15例特应性喘息婴儿、15例非特应性喘息婴儿以及18例异物吸入对照婴儿。数据通过纤维支气管镜经喉罩采集,并使用16S rRNA基因测序技术对细菌群落进行表征。研究分析了组间细菌组成、多样性差异以及基于KEGG通路的预测功能,探索了微生物群在复发性喘息发病机制中的潜在作用,为呼吸道疾病的微生物诊断和机制研究提供数据支持。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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