卵巢癌治疗相关纵向血清蛋白质组重塑:与CA125和HE4动态变化的一致性
该存储库包含支持手稿《卵巢癌治疗相关纵向血清蛋白质组重塑:与CA125和HE4动态变化的一致性》的清洗后数据集。该数据集包括使用Olink® Target 96 Oncology II panel从上皮性卵巢癌和原发性腹膜Müllerian癌患者中生成的纵向血清蛋白质组测量值

基本信息
资源简介
卵巢癌治疗相关纵向血清蛋白质组重塑:与CA125和HE4动态变化的一致性
该数据集为一项卵巢癌治疗相关纵向血清蛋白质组研究的配套清洗数据,旨在支撑相关手稿中关于治疗过程中血清蛋白质组重塑及其与CA125、HE4动态变化一致性的分析。数据集来源于Zenodo,采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可发布,作者为Lukanovic, David与Osredkar, Josko,发布时间为2026年。数据涵盖上皮性卵巢癌和原发性腹膜Müllerian癌患者的纵向血清蛋白质组测量结果,检测平台为Olink® Target 96 Oncology II panel。存储库中除测量值外,还包含样本元数据、数据字典、蛋白质注释以及长格式和宽格式的归一化蛋白质表达(NPX)值。临床标识符已进行假名化处理,不包含可直接识别的个人信息。该数据集可用于验证、复用和重现相关论文中的分析结果。
【数据集背景】
该数据集服务于一项关于卵巢癌治疗相关纵向血清蛋白质组重塑的研究,重点关注蛋白质组变化与CA125和HE4动态变化之间的一致性。卵巢癌及原发性腹膜Müllerian癌患者在治疗过程中的血清蛋白质组变化是研究核心,而CA125和HE4作为常用的临床生物标志物,其动态变化与蛋白质组数据的关联分析构成了该数据集的主要科学背景。数据集以清洗后的形式提供,便于研究者直接用于验证和复现相关分析。
【数据内容】
数据集包含多类内容:样本元数据、数据字典、蛋白质注释,以及归一化蛋白质表达(NPX)值。NPX值同时以长格式和宽格式两种形式提供,方便不同分析流程使用。蛋白质组测量基于Olink® Target 96 Oncology II panel生成,针对上皮性卵巢癌和原发性腹膜Müllerian癌患者的纵向血清样本。临床标识符已假名化,不包含直接可识别的个人信息。关于样本量、时间点数量、具体蛋白质数量等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于Zenodo存储库,源站为doi.org。测量平台为Olink® Target 96 Oncology II panel,样本来自上皮性卵巢癌和原发性腹膜Müllerian癌患者。数据集为支持相关手稿的清洗后数据,临床标识符已假名化处理。关于样本采集的具体时间范围、地点、机构伦理审批信息等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于验证、复用和重现与卵巢癌治疗相关纵向血清蛋白质组重塑及CA125、HE4动态一致性相关的分析。研究者可利用长格式或宽格式的NPX值进行蛋白质组动态分析、生物标志物关联研究或方法学比较。由于包含样本元数据、数据字典和蛋白质注释,也适合用于数据整合、注释标准化或作为方法学参考。关于是否适用于其他癌种、其他治疗背景或其他检测平台,源站未提供。
【使用方法】
使用者可根据研究需求选择长格式或宽格式的NPX值。数据字典和蛋白质注释可用于理解变量含义和蛋白质标识。样本元数据可用于分组或纵向分析。临床标识符已假名化,使用时应遵守相关伦理和数据使用规范。关于具体的分析步骤、软件要求或代码示例,源站未提供。
【质量与限制】
数据集为清洗后数据,临床标识符已假名化,不包含直接可识别的个人信息。测量基于Olink® Target 96 Oncology II panel,针对特定患者群体。关于数据缺失情况、批次效应、归一化方法细节、样本量或统计功效等,源站未提供。使用者应结合数据字典和蛋白质注释评估数据适用性。
【引用与许可】
该数据集采用Creative Commons Attribution 4.0 International许可,使用时需遵循署名要求。作者为Lukanovic, David与Osredkar, Josko,机构为Zenodo,发布时间为2026年。引用时应参考相关手稿及存储库信息。关于具体的引用格式或推荐引用文本,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.21326872
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 551.0 KB。
数据说明
本存储库包含经过清洗的数据集,用于支持论文《卵巢癌中治疗相关的纵向血清蛋白质组重塑:与CA125和HE4动态变化的一致性》。该数据集包含来自上皮性卵巢癌和原发性腹膜苗勒管癌患者的纵向血清蛋白质组测量值,这些测量值使用 Olink® Target 96 Oncology II panel 生成。本存储库包含样本元数据、数据字典、蛋白质注释,以及长格式和宽格式的归一化蛋白表达(NPX)值。临床标识符已进行假名化处理,且不包含任何可直接识别个人身份的信息。该数据集旨在支持对相关出版物中所呈现分析进行验证、复用和可复现性。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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