囊性纤维化肺样条件下铜绿假单胞菌的快速多样化

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A0d8eed21cf6e2e7657e50c30185dba744a09b7e2b0590740e6bee7239dbd8899

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

囊性纤维化（CF）气道的慢性感染由机会性病原体铜绿假单胞菌引起，是成年CF患者发病和死亡的主要原因。长期感染伴随着铜绿假单胞菌对CF肺部环境独特条件的适应，以及该病原体显著分化为表型和遗传上不同的菌株，这些菌株可在患者体内共存数年。然而，人们对这种多样化的原因及其对患者健康的影响知之甚少。在此，我们通过实验表明，与多样化的生态学理论一致，CF气道的营养条件可导致铜绿假单胞菌快速而广泛的多样化。黏蛋白是导致CF气道中厚黏液层相关黏度增加的物质，它对群体内多样化影响甚微，但确实促进了群体间的分化。此外，体外进化重现了……

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。