囊性纤维化肺样条件下铜绿假单胞菌快速多样化的数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.5c38fv8

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 116.8 KB。

数据说明

囊性纤维化(CF)气道的机会性致病菌铜绿假单胞菌的慢性感染是成年CF患者发病和死亡的主要原因。长期感染伴随着铜绿假单胞菌对CF肺部环境独特条件的适应，以及该病原体显著分化为表型和遗传上不同的菌株，这些菌株可以在患者体内共存多年。然而，对于这种多样化的原因及其对患者健康的影响知之甚少。在此，我们通过实验表明，与多样化的生态理论一致，CF气道的营养条件可以导致铜绿假单胞菌快速而广泛的多样化。粘蛋白，这种导致CF气道中厚粘液层相关粘度增加的物质，对种群内多样化影响甚微，但确实促进了种群间的分化。此外，体外进化重现了被认为是慢性感染标志的特征，包括运动性降低和生物膜形成增加，以及在临床分离株集合中观察到的表型范围。

我们的结果表明，营养复杂性和减少的扩散能力能够驱动铜绿假单胞菌的进化多样性，这一过程不依赖于囊性纤维化肺部的其他特征，如活跃的免疫系统或竞争性微生物种群的存在。我们认为，通过产生广泛的表现型和遗传变异供选择作用，多样化可能是慢性感染发展的关键第一步。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。