基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

PRJNA1484641：鼻咽微生物组与轻重症COVID-19严重程度关联

PRJNA1484641 是 NCBI BioProject 数据库中的一项生物项目记录，其英文名称为“Nasopharyngeal microbiome associated with mild and severe COVID-19 severity”，中文可理解为“与轻症和重症 COVID-19 严重程度相关的鼻咽微生物组”。该项目聚焦于鼻咽微生物组与 COVID-19 疾病严重程度之间的关联，数据类型为原始测序读长（Raw sequence reads）。作为 BioProject 体系中的一项记录，它汇集了围绕同一研究目标所产生的生物数据，便于用户在一个统一入口下查找和访问该项目所涉及的数据类型与相关资源。该数据集在分类上归属于呼吸系统疾病 / 其他，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1484641 - BioProject - NCBI”。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种生物项目记录形式，用于汇集与单一研究计划相关的生物数据，这些计划通常来自单一机构或联合体。一个 BioProject 记录为用户提供一个统一的位置，以便查找该项目所产生的多种数据类型。PRJNA1484641 正是在这一框架下建立的记录，其研究主题围绕鼻咽微生物组与 COVID-19 严重程度展开，关注轻症与重症之间的比较。该项目的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其数据以原始测序读长为主要内容形式。

【数据内容】

该数据集的数据类型为原始测序读长（Raw sequence reads）。这些读长来自与鼻咽微生物组相关的研究，研究目标是比较轻症和重症 COVID-19 的严重程度。除“原始测序读长”这一数据类型说明外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读长长度、数据量或其他具体技术参数的信息。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1484641 - BioProject - NCBI”。项目英文名称为“PRJNA1484641: Nasopharyngeal microbiome associated with mild and severe COVID-19 severity”。关于样本采集地点、采集时间、受试者人群特征、伦理审批信息等具体采集细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与鼻咽微生物组及 COVID-19 严重程度相关的研究场景，尤其是需要利用原始测序读长进行微生物组分析、比较轻症与重症差异的研究。由于数据类型为原始测序读长，其潜在用途包括微生物组组成分析、序列比对与分类注释等通用下游分析方向。关于该数据集是否适用于其他特定研究目的，源站未提供进一步说明。

【使用方法】

该数据集可通过 NCBI BioProject 记录（ID 1484641）进行访问。用户可在该记录中查找与项目相关的数据类型和链接。关于具体的数据下载方式、分析流程、软件工具或操作步骤，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集在分类上归属于呼吸系统疾病 / 其他，主题标签为“Raw sequence reads”。关于数据质量评估、测序深度、覆盖度、污染控制、批次效应或其他质量控制指标，源站未提供。关于该数据集在样本量、人群代表性、地域覆盖等方面的限制，源站亦未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可条款或使用限制，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study?acc=PRJNA1484641

访问原始数据

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付，我们提供全链路闭环服务，让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持？联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1484641

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该BioProject包含从实验室确诊SARS-CoV-2感染患者的鼻咽拭子样本中提取的细菌DNA的V3-V4高变区产生的原始16S rRNA基因测序数据。鼻咽样本采集自轻症或重症患者，原始单端测序读长以FASTQ格式提供。这些数据可用于鼻咽微生物群的分类学表征，并支持与COVID-19严重程度相关的微生物多样性和差异丰度类群的分析。该数据集旨在探究呼吸道微生物群与宿主DNA甲基化谱之间的潜在关联，为SARS-CoV-2感染期间宿主-微生物组相互作用提供见解。这些数据公开可用，以促进相关发表成果的可重复性，并支持未来关于鼻咽微生物群的作用及其与宿主表观遗传调控在呼吸道感染和疾病严重程度中相互作用的研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别