中国西南地区食用啮齿动物多器官RNA病毒组分析
该数据集来自NCBI BioProject（ID 1458619），主题为对中国西南地区食用啮齿动物进行多器官RNA病毒组分析，数据主题标签为Raw sequence reads
基本信息
资源简介
中国西南地区食用啮齿动物多器官RNA病毒组分析
PRJNA1458619 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物项目，其英文名称为“Multi-organ RNA virome profiling of edible rodents in Southwest China”。该项目围绕中国西南地区食用啮齿动物开展多器官 RNA 病毒组分析，数据主题标签为 Raw sequence reads。作为 BioProject 体系下的一项记录，它汇聚了与这一研究计划相关的生物数据，便于用户在一个统一入口查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集在本站被归类为呼吸系统疾病 / 其他，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1458619 - BioProject - NCBI”。整体而言，该数据集的核心内容是对中国西南地区食用啮齿动物多个器官的 RNA 病毒组进行测序分析，并以原始序列读段的形式提供数据。
【数据集背景】
BioProject 是 NCBI 提供的一种生物数据组织方式，用于汇集与某一项研究计划相关的生物数据。按照源站描述，一个 BioProject 可以来自单一机构或联合体，其记录为用户提供一个统一的位置，以便找到该项目所产生的不同类型数据。PRJNA1458619 正是这样一个 BioProject 记录，编号为 1458619。该项目的主题聚焦于中国西南地区食用啮齿动物的多器官 RNA 病毒组分析。从研究主题看，它关注的是食用啮齿动物这一特定动物群体，并对其多个器官中的 RNA 病毒组进行刻画。此类项目通常服务于病毒发现、病毒多样性调查以及潜在跨种传播风险相关的研究方向，但该数据集具体的研究结论、样本数量、器官种类、病毒种类等信息，源站未提供。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Raw sequence reads，表明其数据内容以原始序列读段为主。原始序列读段通常来自高通量测序平台，是后续拼接、注释和病毒鉴定等分析的基础数据形式。该 BioProject 围绕中国西南地区食用啮齿动物的多器官 RNA 病毒组分析而建立，因此其数据在主题上应与多器官样本的 RNA 病毒组测序相关。不过，关于具体的测序平台、读长、数据量、样本数量、器官类型、病毒分类信息、是否包含组装序列或注释文件等，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自 NCBI BioProject，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1458619 - BioProject - NCBI”。项目英文名称表明其研究对象为中国西南地区的食用啮齿动物，研究内容为多器官 RNA 病毒组分析。关于样本采集的具体地点、时间、啮齿动物物种、器官种类、采样方法、伦理审批信息以及数据提交机构等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于与 RNA 病毒组分析相关的场景，例如对食用啮齿动物多器官样本中的病毒序列进行筛查、病毒多样性探索以及原始测序数据的再分析。由于主题标签为 Raw sequence reads，它适合需要从原始读段出发开展拼接、比对、病毒鉴定和丰度分析的用户。该数据集在本站被归类为呼吸系统疾病 / 其他，因此也可能被用于与呼吸系统疾病相关的数据检索或交叉参考场景。但该数据集是否直接涉及呼吸系统疾病、是否包含相关病原信息，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 记录查找该项目，并依据项目编号获取与其关联的数据。由于该记录的主题标签为 Raw sequence reads，使用者通常需要下载原始序列读段，再结合自身分析流程进行质量控制、拼接、比对和病毒注释。具体的数据下载方式、文件格式、访问链接、是否需要特定工具或权限等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 BioProject 记录，提供的是与项目相关的数据入口，而非经过统一质控或标准化分析后的最终结果。原始序列读段的质量、覆盖度、污染情况以及样本代表性等，取决于原始研究的设计与实验过程，源站未提供相关质量指标。该数据集的主题为中国西南地区食用啮齿动物的多器官 RNA 病毒组，其结论和适用范围可能受地域、物种、器官类型和采样范围限制，但具体限制条件源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许再分发等信息，源站未提供。用户在使用时应自行查阅 NCBI BioProject 记录及相关数据页面以确认引用要求和许可条件。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1458619
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本项目旨在利用宏转录组测序技术，对中国西南贵州省采集的可食用啮齿动物的RNA病毒组进行表征。共分析了来自三种常被食用的啮齿动物（安氏白腹鼠、青毛巨鼠和黄毛鼠）的15份混合组织样本，涵盖五种内脏器官（肺、肝、脾、肾和肠道）。研究重点在于分析病毒多样性、宿主相关病毒组组成以及组织特异性分布模式。此外，特别关注与人兽共患病病毒及家畜相关病毒有关的病毒序列，以探索野生动物-家畜-人类交界处的潜在生态联系和暴露风险。所生成的数据集为了解野生动物RNA病毒多样性提供了资源，并为未来的病原体监测和One Health风险评估研究提供了支持。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
