PRJNA1301244：慢性阻塞性肺疾病（COPD）人肺组织单核转录组图谱
该数据集为 NCBI BioProject 编号 PRJNA1301244 的项目记录，主题为慢性阻塞性肺疾病（COPD）人肺组织的单核转录组图谱分析，主题标签为 Raw sequence reads
基本信息
资源简介
PRJNA1301244：慢性阻塞性肺疾病（COPD）人肺组织单核转录组图谱
PRJNA1301244 是 NCBI BioProject 数据库中的一项项目记录，其英文名称为“Single-nucleus transcriptomic profiling of human lung tissue in chronic obstructive pulmonary disease (COPD)”，中文可理解为慢性阻塞性肺疾病（COPD）人肺组织的单核转录组图谱分析。该项目的主题标签为“Raw sequence reads”，表明其数据内容与原始序列读长相关。本站将其归入呼吸系统疾病 / 其他分类，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。整体来看，该数据集围绕慢性阻塞性肺疾病这一呼吸系统疾病，借助单核转录组分析技术，对人肺组织展开研究，为相关领域的研究者提供了一个可追溯、可链接的 BioProject 项目入口。
【数据集背景】
慢性阻塞性肺疾病（COPD）是一种常见的呼吸系统疾病，其病理机制和细胞层面的变化一直是研究关注的重点。单核转录组分析能够在单细胞核水平上解析组织内不同细胞类型的基因表达特征，因而被应用于人肺组织的研究。该数据集对应的 BioProject 编号为 PRJNA1301244，其英文名称明确指向“慢性阻塞性肺疾病（COPD）人肺组织的单核转录组图谱分析”。从源站标题“ID 1301244 - BioProject - NCBI”可以看出，该记录属于 NCBI 的 BioProject 体系。BioProject 是围绕某一特定研究计划或项目而汇集生物数据的集合，通常来源于单一机构或联合体，并为用户提供统一入口，以查找该项目所产生的多种数据类型。因此，该数据集在背景上属于以 COPD 人肺组织为研究对象、以单核转录组图谱分析为核心内容的项目记录。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”，说明其涉及的数据类型与原始序列读长有关。项目英文名称中包含“Single-nucleus transcriptomic profiling”，即单核转录组图谱分析，研究对象为人肺组织，疾病背景为慢性阻塞性肺疾病（COPD）。源站描述指出，BioProject 记录为用户提供一个单一位置，以查找为该项目生成的多种数据类型之间的链接。因此，该数据集的内容并非单一文件，而是围绕 PRJNA1301244 这一项目编号所组织的数据集合入口。除上述信息外，关于具体样本数量、测序平台、读长长度、数据量等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1301244 - BioProject - NCBI”。其项目编号为 PRJNA1301244，属于 NCBI BioProject 数据库中的一条记录。根据源站描述，BioProject 是围绕单一研究计划而汇集生物数据的集合，可能来自单一组织或联合体。该项目的英文名称表明其研究材料为人肺组织，研究疾病为慢性阻塞性肺疾病（COPD），研究手段为单核转录组图谱分析。本站将其分类为呼吸系统疾病 / 其他。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、受试者来源等具体采集细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与慢性阻塞性肺疾病（COPD）人肺组织单核转录组分析相关的研究场景。由于主题标签为“Raw sequence reads”，其原始序列读长可用于转录组层面的数据分析，例如基因表达定量、细胞类型鉴定以及细胞异质性探索等通用分析方向。同时，作为 BioProject 记录，它也可作为项目入口，帮助研究者定位与该研究计划相关的多种数据类型。对于呼吸系统疾病领域的研究人员而言，该数据集可用于了解 COPD 肺组织在单核转录组水平上的项目组织方式。但需注意，具体适用性取决于数据本身的质量与设计，源站未提供更详细的适用条件说明。
【使用方法】
使用者可通过 NCBI BioProject 数据库，以项目编号 PRJNA1301244 进行检索，访问该项目的记录页面。源站描述指出，BioProject 记录为用户提供单一位置，以查找为该项目生成的多种数据类型之间的链接。因此，使用方法上，用户可先通过该记录页获取相关数据的链接，再根据主题标签“Raw sequence reads”定位原始序列读长数据。关于具体的下载方式、数据格式、分析流程、软件工具及参数设置等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 NCBI BioProject 项目记录，其质量与限制信息在源站描述中未具体展开。源站仅说明 BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的集合，并提供多种数据类型的链接入口。关于数据质量评估、测序深度、覆盖度、批次效应、样本量、统计效力等具体指标，源站未提供。此外，该记录的主题标签为“Raw sequence reads”，提示其涉及原始序列读长，但原始数据通常需要经过质控与预处理后方可用于下游分析。使用者应结合项目页面提供的链接信息自行判断数据适用性。除上述内容外，源站未提供其他质量与限制说明。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“ID 1301244 - BioProject - NCBI”，项目编号为 PRJNA1301244。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款及版权信息，源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时，应访问 NCBI BioProject 对应记录页面，以获取最新的引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1301244
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
慢性阻塞性肺疾病（COPD）在临床和分子层面均具有异质性。为了探究COPD的异质性，我们对涵盖全疾病谱的COPD患者及非COPD个体的肺组织进行了单核RNA测序（snRNA-seq）。我们从141名受试者的146个肺叶中获得了1,516,727个高质量细胞转录组。该数据集捕捉到了上皮、基质和免疫细胞群体中细胞组成及疾病相关细胞状态的广泛变化。这些数据界定了COPD异质性的细胞图谱，揭示了可为治疗策略提供信息的分子驱动因素和生物标志物。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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