PRJNA1102754:转录组测序揭示急性呼吸窘迫综合征人肺微血管内皮细胞circRNA差异表达

该数据集来自NCBI,为急性呼吸窘迫综合征(ARDS)相关的人肺微血管内皮细胞转录组测序原始序列数据。研究旨在探索circRNA在ARDS肺微血管通透性中的作用机制,通过转录组测序揭示circRNA的差异表达

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基因组分类Raw sequence reads
PRJNA1102754: Transcriptome sequencing reveals differential expression of circRNAs in human pulmonary microvascular endothelial cells in acute respiratory distress syndrome

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA1102754:转录组测序揭示急性呼吸窘迫综合征人肺微血管内皮细胞circRNA差异表达

PRJNA1102754 数据集来自 NCBI,主题标签为原始序列读取(Raw sequence reads),属于呼吸系统疾病 / 其他分类。该数据集围绕急性呼吸窘迫综合征(ARDS)展开,采用转录组测序技术对人肺微血管内皮细胞进行测序,旨在揭示环状 RNA(circRNA)的差异表达情况,并探索 circRNA 在 ARDS 肺微血管通透性中的作用机制。数据集提供的原始序列数据可为相关机制研究提供转录层面的基础素材,服务于呼吸系统疾病特别是 ARDS 血管内皮功能方向的科研分析。

【数据集背景】

急性呼吸窘迫综合征是一种以肺微血管通透性异常升高为特征的呼吸系统危重疾病。为发现 circRNA 在 ARDS 肺微血管通透性中所起作用背后的机制,该数据集对应的研究选择人肺微血管内皮细胞作为研究对象,通过转录组测序手段考察 circRNA 的表达变化。数据集英文名称明确表述其研究内容为“转录组测序揭示急性呼吸窘迫综合征中人肺微血管内皮细胞 circRNA 的差异表达”,与源站描述所指向的研究目的相一致,即围绕 circRNA 在肺微血管通透性中的作用机制开展探索。

【数据内容】

该数据集的主题标签为“Raw sequence reads”,表明其内容形式为测序产生的原始序列读取数据。数据来源于人肺微血管内皮细胞的转录组测序,研究关注的核心数据结果是 circRNA 的差异表达信息。数据集分类归入呼吸系统疾病 / 其他。除上述内容外,源站未提供关于样本数量、测序平台、读长、数据量、文件格式及具体差异表达基因或 circRNA 列表等更细化的信息。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),以 PRJNA1102754 为标识。其研究对象为人肺微血管内皮细胞,采集与分析手段为转录组测序。关于样本的具体来源、供体信息、细胞培养条件、测序建库流程与测序仪器型号等,源站未提供。

【适用场景】

基于其研究主题与数据形式,该数据集适用于围绕 ARDS 肺微血管通透性机制开展的转录组层面研究,尤其是 circRNA 差异表达相关的分析工作,例如 circRNA 表达谱的重新分析、候选 circRNA 的筛选与验证,以及与其他呼吸系统疾病转录组数据的比较研究。同时,作为原始序列读取数据,也可用于测序数据处理流程的复现与方法学参考。关于该数据集在其他具体应用场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以原始序列读取的形式提供,常规使用方式为下载原始测序数据后开展质量控制、比对与 circRNA 识别及差异表达分析等下游处理。具体的分析流程、推荐参数、参考基因组版本及配套分析工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 NCBI 收录的原始序列读取数据,其质量评估指标、测序深度、数据完整性说明及已知技术限制,源站未提供。使用时应结合自身分析目的对数据进行必要的质量控制与验证。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI,标识为 PRJNA1102754。关于数据集的引用方式、发表文献信息及使用许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1102754

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

探讨循环RNA(circRNA)在急性呼吸窘迫综合征(ARDS)肺微血管通透性中作用的机制。

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