A/J 小鼠肺部感染 Cryptococcus neoformans(血清型 A)临床分离株数据集

主题标签:呼吸系统疾病、肺部感染、临床分离株、A/J 小鼠、蛋白质组学。本数据集为呼吸系统疾病领域公开数据集,主题涵盖呼吸系统疾病。

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蛋白质呼吸系统疾病肺部感染临床分离株A/J 小鼠蛋白质组学
Mus musculus (A/J) lung infection with Cryptococcus neoformans (serotype A) clinical isolates

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

A/J 小鼠肺部感染 Cryptococcus neoformans(血清型 A)临床分离株数据集

该数据集英文名为 Mus musculus (A/J) lung infection with Cryptococcus neoformans (serotype A) clinical isolates,来源于 ebi.ac.uk,在分类上归属于呼吸系统疾病 / 其他。其主题标签涵盖呼吸系统疾病、肺部感染、临床分离株、A/J 小鼠与蛋白质组学,是一项面向呼吸系统疾病领域的公开数据集。从名称与主题标签可以看出,该数据集围绕 A/J 小鼠肺部感染新生隐球菌(血清型 A)临床分离株这一实验场景组织,属于蛋白质组学范畴的公开数据资源,可供相关领域研究者检索与使用。以下依据可获得的信息,对该数据集作分段介绍。

【数据集背景】

该数据集关注的是呼吸系统疾病中的肺部感染问题。新生隐球菌(Cryptococcus neoformans)血清型 A 的临床分离株被用于感染 A/J 小鼠的肺部,构成该数据集的生物学背景。数据集以小鼠为宿主模型,以临床分离株为感染源,主题标签同时指向呼吸系统疾病与蛋白质组学,说明其面向的是感染过程相关的蛋白质组层面研究。源站将其收录于呼吸系统疾病 / 其他分类之下,表明其在该分类体系中属于呼吸系统疾病范畴内的其他类目。

【数据内容】

依据主题标签,该数据集的内容涉及呼吸系统疾病、肺部感染、临床分离株、A/J 小鼠以及蛋白质组学等方面。数据集名称明确指向 A/J 小鼠肺部感染新生隐球菌血清型 A 临床分离株这一实验体系。关于数据的具体组成、文件类型、样本数量、蛋白或肽段鉴定数量等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk。源站描述中给出的引用信息为:Jovany Betancourt (2025). Mus musculus (A/J) lung infection with Cryptococcus neoformans (serotype A) clinical isolates [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD063417。关于样本采集流程、实验设计、仪器平台与数据处理流程等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

结合主题标签,该数据集可适用于呼吸系统疾病领域,尤其是肺部感染相关的研究场景,并可服务于以 A/J 小鼠为模型的感染研究以及蛋白质组学方向的检索与比较分析。关于其具体的适用分析类型与推荐用途,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过 ebi.ac.uk 提供访问,源站描述中给出了对应的项目链接。关于数据下载方式、文件组织格式、使用条件与操作步骤等具体说明,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开数据集,来源站为 ebi.ac.uk。关于数据质量评估指标、完整性说明、已知偏差与使用限制等内容,源站未提供。

【引用与许可】

引用信息为:Jovany Betancourt (2025). Mus musculus (A/J) lung infection with Cryptococcus neoformans (serotype A) clinical isolates [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD063417。关于该数据集的许可条款与使用授权细节,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD063417

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Jovany Betancourt (2025). Mus musculus (A/J) lung infection with Cryptococcus neoformans (serotype A) clinical isolates [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD063417

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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