血液恶性肿瘤患者侵袭性真菌病的mNGS研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07763184

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

研究条件：血液系统恶性肿瘤、侵袭性真菌病。侵袭性真菌病（IFD）是指真菌侵入人体，在组织、器官或血液中生长繁殖，导致炎症反应和组织损伤的感染性疾病。由于疾病本身及治疗过程中免疫系统功能受到抑制，血液系统恶性肿瘤患者易发生机会性感染，包括IFD，其中肺部是最常见的感染部位。在血液系统恶性肿瘤患者中，IFD往往难以诊断且进展迅速，部分患者病情危重，严重影响其预后。随着分子生物学技术的快速发展，病原微生物宏基因组二代测序（mNGS）作为一种覆盖范围广、灵敏度高、报告周期短的诊断工具，已广泛应用于临床感染性疾病的病原学诊断。然而，其在IFD诊断中的临床价值仍有待探索。

本研究是一项单中心、单臂、开放标签的临床研究，旨在探讨外周血mNGS在血液系统恶性肿瘤患者IFD诊断和治疗中的临床表现。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。