铁摄取缺陷增强新型隐球菌对唑类抗真菌药物敏感性的转录组数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE37875

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数据说明

野生型与cfo1突变体在氟康唑处理下的转录组分析——以新型隐球菌格鲁比变种H99为研究对象

目的：本研究旨在比较新型隐球菌格鲁比变种H99中cfo1突变体（无论是否经氟康唑处理）与野生型（无论是否经氟康唑处理）的转录组图谱（RNA-seq）。

方法：采用Illumina GAIIx平台，通过RNA-Seq技术生成野生型与cfo1突变体（经或未经氟康唑处理）的mRNA图谱。将通过质量过滤的序列读段比对至参考基因组，并使用CLC Genomics Workbench计算归一化的RPKM值。

结果：与野生型相比，cfo1突变体中有多个基因存在差异表达，尤其是涉及铁稳态与转运、麦角固醇生物合成、线粒体功能及呼吸作用的基因。

结论：我们的数据表明，呼吸链相关基因表达降低是cfo1突变体抗真菌敏感性改变的主要原因。研究结果揭示了铁摄取在新型隐球菌对氟康唑敏感性中发挥关键作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。