新型隐球菌RNA沉默组分分子与功能表征[RNAi_血清型A]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE21176

标准获取流程：

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数据说明

由小RNA分子介导的、依赖同源序列降解靶mRNA的RNA干扰（RNAi）在多种真核生物中控制转录和翻译过程中发挥关键作用。RNAi机制在包括病原真菌在内的多种真菌物种中也具有进化保守性。为阐明RNAi途径在引起真菌性脑膜炎的新型隐球菌中的生理功能，本研究对血清型A和D新型隐球菌中编码Argonaute（AGO1和AGO2）、RdRP（RDP1）和Dicer（DCR1和DCR2）的基因进行了遗传学分析。本研究表明，Ago1、Rdp1和Dcr2是新型隐球菌中RNAi过程的主要组分。然而，RNAi机制不参与两种毒力因子（荚膜和黑色素）产生的调控、有性分化以及多种应激反应。为进一步深入了解由RNAi途径调控的全局调控网络，利用血清型A和D的RNAi突变体进行了比较转录组分析。

值得注意的是，在rdp1Δ突变体中观察到了活跃转座子（如T2和T3）转录本丰度的增加。因此，本研究有助于增进我们对RNAi基因在包括新型隐球菌在内的人类真菌病原体中所起作用的理解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。