研究胃肠道系统囊性纤维化病理生理的果蝇模型

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE246379

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数据说明

囊性纤维化(CF)是一种由CF跨膜传导调节因子(CFTR)基因突变引起的隐性遗传病。最常见的症状包括进行性肺病和慢性消化系统疾病。CF是首个受益于拥有五种不同动物模型的入类遗传病。尽管动物模型与人类CF之间存在表型差异，但这些模型为在器官系统层面理解疾病机制提供了宝贵的见解。在此，我们鉴定出ABCC4家族的一个成员CG5789，其结构和功能特性符合编码人类CFTR果蝇等效物的预期，因此将其称为果蝇CFTR(Dmel\CFTR)。我们发现，在成体肠道中敲低Dmel\CFTR会破坏渗透稳态，并表现出类似CF的表型，导致肠道干细胞增生。

我们还发现，野生型人CFTR的表达能够挽救Dmel\CFTR突变体的表型，而阻止质膜表达的CFTR突变变体则不能。此外，我们利用Dmel\CFTR果蝇肠道进行了基于RNA测序（RNA-Seq）的转录组分析，并鉴定出一个黏蛋白基因Muc68D，该基因对于适当的肠道屏障保护是必需的。综上所述，我们的研究结果表明，果蝇可以作为研究CF病理生理学的强大模式生物。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。