果蝇眼触角成虫盘过表达RP相关Prp8突变蛋白的基因表达评估

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE139361

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

视网膜色素变性（RP）是一组以进行性视力丧失为特征的异质性遗传性眼病。三十个不同基因的突变与常染色体显性遗传型RP（adRP）相关，其中近四分之一的基因编码剪接体的核心组分，剪接体是一种大分子机器，负责从新生的前体mRNA中移除内含子，生成成熟转录本。在此，我们建立了与RP13相关的黑腹果蝇模型，RP13与剪接体中最保守的蛋白PRPF8/Prp8的突变相关。我们证明，九种不同的RP相关Prp8突变蛋白在专门产生主要昆虫蜕皮激素的内分泌细胞中表达时，对发育时序产生负面影响。在发育中的眼原基中，活跃分裂的细胞而非分化的光感受器对Prp8功能障碍表现出敏感性。两种毒性最强的RP变体Prp8S>F和Prp8H>R的过表达诱导了细胞凋亡和成体眼形态的紊乱。虽然受影响组织启动了应激和细胞保护反应，但支撑神经元功能的遗传程序被削弱。

重要的是，RP-Prp8突变的外显率和表现度存在差异，并在prp8杂合状态下增加。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。