寄生虫感染实验:三刺鱼适合度数据

包含一个表格,其中有八项鱼类适合度性状的值。所测量的适合度性状包括鱼的长度(mm)和重量(g)、使用log10转换后的体重对log10转换后的体长进行线性回归的残差估计的体况、头肾重量(g)、肝脏重量(g)、睾丸重量(g)、呼吸爆发活性和精子活力浓度(精子数/µL)(Sperm concentrat

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表格回归三刺鱼寄生虫感染适合度性状呼吸爆发活性精子活力鱼类免疫
Experiment on parasite infection: Fitness data of Gasterosteus aculeatus

基本信息

模态
表格
任务类型
回归
许可
https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
创建/更新时间
2026-10-31

资源简介

寄生虫感染实验:三刺鱼适合度数据

该数据集英文名为 Experiment on parasite infection: Fitness data of Gasterosteus aculeatus,来源于 search.dataone.org,本站将其归类于呼吸系统疾病 / 其他。数据集核心是一张表格,记录了八项鱼类适合度性状的测量值,同时给出与每条鱼对应的标识与背景信息,包括鱼编号、物种名、所属家系、解剖年份、处理组和性别。所测量的适合度性状涵盖鱼的长度(mm)与重量(g)、体况、头肾重量(g)、肝脏重量(g)、睾丸重量(g)、呼吸爆发活性以及精子活力浓度(精子数/µL)。该数据集以知识共享署名—非商业性使用 4.0 国际许可协议(CC BY-NC 4.0)发布,可用于与寄生虫感染相关的鱼类适合度研究。

【数据集背景】

该数据集围绕寄生虫感染实验展开,实验对象为 Gasterosteus aculeatus(三刺鱼)。从源站描述可知,数据服务于对鱼类适合度性状的观测与比较,实验设计中包含处理组(Treatment)这一分组变量,表明个体在实验中接受了不同的处理条件。数据同时记录了解剖年份与家系信息,便于在时间与遗传背景两个维度上组织样本。本站分类将其归入呼吸系统疾病 / 其他,这一分类提供了该数据集在本站体系中的位置参考。关于实验的具体寄生虫种类、感染方式与实验周期等背景细节,源站未提供。

【数据内容】

数据集以表格形式组织,每一行对应一条鱼个体,列包括鱼编号、物种名、家系编号、解剖年份、处理组与性别等标识信息,以及八项适合度性状的测量值。八项性状分别为:鱼的长度(单位 mm)、鱼的重量(单位 g)、体况、头肾重量(单位 g)、肝脏重量(单位 g)、睾丸重量(单位 g)、呼吸爆发活性、精子活力浓度(单位:精子数/µL)。其中体况并非直接测量值,而是通过统计建模估计得到:对体重与体长分别作 log10 转换后建立线性回归,以该回归的残差作为体况的度量。呼吸爆发活性的具体测定方法与单位,源站未提供。各性状的样本量、缺失情况与取值范围,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 search.dataone.org。表格中记录了解剖年份,说明性状测量是在解剖过程中完成的;家系编号与鱼编号的存在表明样本可按家庭与个体两个层级追溯。处理组字段记录了实验分组。关于采集地点、采样时间跨度、样本总数、测量仪器与操作流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于所记录的性状,该数据集适用于分析寄生虫感染实验条件下鱼类多种适合度相关指标的表现,例如比较不同处理组之间在体长、体重、体况、免疫相关指标(头肾重量、呼吸爆发活性)与繁殖相关指标(睾丸重量、精子活力浓度)上的差异;也可用于考察同一家系内个体性状的相似性,或结合解剖年份分析性状的时间变化。体况作为体重与体长回归残差,适合在控制体型差异后比较个体的相对身体状况。由于本站将其归类于呼吸系统疾病 / 其他,该数据亦可作为相关主题下的参考数据使用。具体研究设计与统计模型需依据使用者的研究问题确定。

【使用方法】

使用时可按鱼编号唯一标识个体,按家系编号聚合个体以形成家系层级,按处理组与性别进行分组比较,按解剖年份进行分层或时间趋势分析。对体况字段,应注意其为 log10 转换后体重对 log10 转换后体长的线性回归残差,使用前宜确认转换与回归的具体设定;源站未提供该回归的拟合细节。长度与各重量字段单位不同(mm 与 g),比较时需注意单位一致性。涉及多性状联合分析时,应留意不同性状可能存在的缺失与样本量差异;源站未提供缺失情况说明。

【质量与限制】

该数据集为实验观测表格,性状定义在源站描述中较为明确,尤其是体况的计算方式已给出。但源站未提供样本总量、缺失值比例、测量重复性、异常值处理与数据校验方法等信息,使用者在建模前应自行核查。呼吸爆发活性与精子活力浓度的测定细节与单位说明不完整,跨研究比较时需谨慎。数据许可为 CC BY-NC 4.0,限定了使用范围。

【引用与许可】

该数据集采用知识共享署名—非商业性使用 4.0 国际许可协议(CC BY-NC 4.0),许可地址为 https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/。使用时应遵守该协议关于署名与非商业性使用的要求。数据来源站为 search.dataone.org。具体的引用格式与作者信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3A6ce70ae1cd21b6daf3a8b4414db1ed42ae53afe09ec4eba407c19e03ede7c9f7

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

包含一个表格,列出了八项鱼类适合度性状的值。此外,还给出了鱼类ID编号(Fish_ID)、物种名称(Species)、鱼科(Family_ID)、解剖年份(Year)、处理(Treatment)和鱼性别(Sex)。所测量的适合度性状包括鱼的长度(mm)和体重(g)、使用log10转换体重对log10转换体长线性回归残差估计的体况、头肾重量(g)、肝脏重量(g)、睾丸重量(g)、呼吸爆发活性以及精子活力浓度(精子数/µL)(Sperm concentration)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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