E-MTAB-7962:健康对照下鼻甲与糖皮质激素治疗N-ERD鼻息肉鼻刷检总RNAseq

该数据集来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验,物种为 Homo sapiens,包含健康对照下鼻甲与经糖皮质激素治疗的 NSAID 加重呼吸道疾病(N-ERD)鼻息肉鼻刷检样本的总 RNAseq 数据

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基因组分类Differential
E-MTAB-7962: Total RNAseq of human healthy control inferior turbinate and glucocorticoid-treated, NSAID-exacerbated respiratory disease (N-ERD) nasal polyp nasal brushings

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

E-MTAB-7962:健康对照下鼻甲与糖皮质激素治疗N-ERD鼻息肉鼻刷检总RNAseq

E-MTAB-7962 是一项总 RNAseq 差异表达实验数据集,物种为 Homo sapiens。该实验对比了健康对照的下鼻甲样本与经糖皮质激素治疗的、NSAID 加重呼吸道疾病(N-ERD)患者的鼻息肉鼻刷检样本,用于在转录组层面观察两组样本之间的基因表达差异。数据集收录于 EBI Expression Atlas,属于差异表达类实验,本站将其归入呼吸系统疾病 / 其他分类。整体而言,该数据集围绕鼻腔局部组织的总 RNA 测序展开,涉及健康对照与特定疾病治疗状态下的样本对照,可为呼吸系统疾病相关转录组研究提供数据参考。

【数据集背景】

该数据集来源于 EBI Expression Atlas 的差异表达实验。Expression Atlas 是面向基因表达实验的公共资源,本实验以 Homo sapiens 为研究对象,聚焦于鼻腔局部组织的转录组比较。实验设计涉及两类样本:健康对照的下鼻甲,以及经糖皮质激素治疗的 NSAID 加重呼吸道疾病(N-ERD)患者的鼻息肉鼻刷检样本。N-ERD 即 NSAID 加重呼吸道疾病,本数据集所涉及的样本处于糖皮质激素治疗背景之下,这一治疗状态是理解该实验样本构成的重要背景信息。

【数据内容】

数据集的核心内容是总 RNAseq 数据,即对样本进行总 RNA 测序所得的转录组数据。样本类型包括健康对照的下鼻甲与 N-ERD 患者经糖皮质激素治疗后的鼻息肉鼻刷检样本。实验类型为差异表达分析,主题标签为 Differential,表明该数据集的主要产出方向是比较上述两组样本之间的基因表达差异。关于具体的样本数量、测序平台、读长、基因数量、差异表达基因列表及统计阈值等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来自 ebi.ac.uk,即 EBI Expression Atlas 实验条目 E-MTAB-7962。源站描述明确其物种为 Homo sapiens,实验类型为差异表达,样本涉及健康对照下鼻甲与经糖皮质激素治疗的 N-ERD 鼻息肉鼻刷检样本的总 RNAseq。关于样本采集的具体流程、伦理审批信息、采集地点与时间、处理与保存条件等,源站未提供。

【适用场景】

基于其差异表达实验的性质,该数据集适用于呼吸系统疾病领域的转录组比较研究,尤其是围绕 N-ERD 与健康对照之间基因表达差异的探索性分析。由于样本涉及经糖皮质激素治疗的 N-ERD 鼻息肉鼻刷检样本,也可用于关注治疗背景下鼻腔局部组织表达谱变化的研究场景。此外,该数据集可作为总 RNAseq 差异表达分析的教学或方法学参考数据。关于其在特定疾病机制、生物标志物发现或临床转化中的具体适用性,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以 EBI Expression Atlas 实验条目的形式提供,使用者可通过源站条目获取实验相关信息与数据。关于数据下载格式、文件组织方式、分析流程、标准化处理方法及配套工具等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为差异表达实验,样本涉及健康对照与经糖皮质激素治疗的 N-ERD 患者两类来源,样本构成具有明确的组间对照设计。关于数据质量评估指标、批次效应、样本量、测序深度、重复数及潜在混杂因素等,源站未提供。使用时应结合源站条目所载信息自行评估数据适用性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-7962

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Total RNAseq of human healthy control inferior turbinate and glucocorticoid-treated, NSAID-exacerbated respiratory disease (N-ERD) nasal polyp nasal brushings

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