E-MTAB-5157:柴油与生物质超细颗粒物暴露的人支气管上皮细胞BEAS-2B转录谱
该数据集来自EBI的Expression Atlas实验,属于差异表达分析类型,物种为Homo sapiens。数据内容为人支气管上皮细胞BEAS-2B暴露于柴油和生物质超细颗粒物后的转录谱

基本信息
资源简介
E-MTAB-5157:柴油与生物质超细颗粒物暴露的人支气管上皮细胞BEAS-2B转录谱
E-MTAB-5157 是一个来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集,物种为 Homo sapiens。该数据集围绕人支气管上皮细胞 BEAS-2B 展开,研究其在暴露于柴油超细颗粒物和生物质超细颗粒物后的转录谱变化。作为呼吸道疾病相关数据资源,它属于“其他”子类,主题标签为 Differential,表明其核心分析类型是差异表达分析。数据集英文全称为 “Transcriptional profiling of human bronchial epithelial cell BEAS-2B exposed to diesel and biomass ultrafine particles”,直观概括了实验对象、处理条件与检测层面。该数据集可用于了解颗粒物暴露对支气管上皮细胞基因表达的影响,为呼吸道疾病相关研究提供转录组层面的实验数据参考。
【数据集背景】
该数据集来自 EBI 的 Expression Atlas 实验,属于差异表达分析类型。Expression Atlas 是 EBI 提供的基因表达数据资源,汇集了不同物种、不同实验条件下的表达谱研究。E-MTAB-5157 的物种为 Homo sapiens,研究背景聚焦于人支气管上皮细胞 BEAS-2B 在柴油和生物质超细颗粒物暴露条件下的转录响应。呼吸道疾病分类提示该数据与呼吸系统相关研究领域存在关联,而“其他”子类表明其并未归入更具体的疾病类型。主题标签 Differential 说明该实验的核心目的在于识别不同暴露条件之间具有表达差异的基因或转录本。
【数据内容】
数据内容为人支气管上皮细胞 BEAS-2B 暴露于柴油和生物质超细颗粒物后的转录谱。源站描述指出,该实验是对人支气管上皮细胞 BEAS-2B 进行转录谱分析,处理条件包括柴油超细颗粒物和生物质超细颗粒物。作为差异表达实验,其数据应包含在不同暴露条件下比较得到的基因表达变化信息。数据集英文名称中的 “Transcriptional profiling” 表明检测层面为转录水平,即对 RNA 表达进行全局或高通量分析。主题标签 Differential 进一步确认该数据集的核心内容为差异表达结果,而非单纯的基线表达谱。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,即欧洲生物信息研究所(EBI)的 Expression Atlas 实验资源。源站描述明确其物种为 Homo sapiens,实验类型为 Differential。数据集英文名称为 “E-MTAB-5157: Transcriptional profiling of human bronchial epithelial cell BEAS-2B exposed to diesel and biomass ultrafine particles”。本站分类为呼吸道疾病 / 其他,来源站为 ebi.ac.uk。除上述来源信息外,关于样本采集地点、时间、具体实验操作流程、测序平台或阵列平台等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于差异表达分析相关的转录组研究场景,尤其是涉及人支气管上皮细胞 BEAS-2B 对柴油和生物质超细颗粒物暴露响应的研究。由于主题标签为 Differential,它可用于比较不同暴露条件下基因表达差异,帮助识别受颗粒物影响的基因或通路。在呼吸道疾病 / 其他分类下,该数据可作为呼吸系统相关基础研究的参考数据,用于探索超细颗粒物暴露与支气管上皮细胞转录变化之间的关系。此外,该数据集也可用于方法学验证、差异表达分析流程测试,或作为 Expression Atlas 中同类实验的对照参考。具体应用方向需结合源站提供的实验设计和分析结果进一步确定。
【使用方法】
该数据集可通过 EBI Expression Atlas 获取,具体访问方式、下载格式、分析工具和可视化界面需参照源站说明。由于其为差异表达实验,使用者通常需要关注实验分组、比较组设置以及差异表达统计结果。源站未提供关于数据下载、预处理步骤、标准化方法、分析软件或代码的详细说明。因此,在实际使用时应以 EBI Expression Atlas 页面提供的元数据和操作指引为准。若需进行二次分析,应确认原始数据或处理后数据的可获取性,并遵循源站的数据使用要求。
【质量与限制】
该数据集来自 EBI Expression Atlas,属于经过整理的差异表达实验资源,来源站为 ebi.ac.uk。其物种明确为 Homo sapiens,实验类型为 Differential,主题标签为 Differential。然而,关于样本量、生物学重复数、测序深度、覆盖度、差异表达显著性阈值、多重检验校正方法、批次效应处理等质量相关指标,源站未提供。此外,该数据集仅涉及 BEAS-2B 细胞系,不能直接等同于原代细胞或人体内真实暴露情况。使用者在解释结果时需注意细胞系模型的局限性,以及柴油和生物质超细颗粒物暴露条件与真实环境暴露之间的差异。其他质量与限制信息源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ebi.ac.uk,属于 EBI Expression Atlas 实验资源。关于引用方式、许可协议、使用条款、原始文献出处以及数据再分发条件,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时,应访问 EBI Expression Atlas 对应页面,查阅其官方引用指南和许可声明。若源站页面未明确许可信息,应遵循 EBI 通用数据使用政策或联系相关数据提供方。除来源站信息外,本数据集的具体引用与许可细节源站未提供。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-MTAB-5157
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Transcriptional profiling of human bronchial epithelial cell BEAS-2B exposed to diesel and biomass ultrafine particles
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




