人气道上皮细胞条件化单核细胞衍生树突状细胞的转录谱分析

该数据集来自 EBI Expression Atlas 的差异表达实验,物种为 Homo sapiens,内容为人气道上皮细胞条件化单核细胞衍生树突状细胞的转录谱分析

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基因组分类Differential
E-GEOD-12773: Transcription profiling of human airway epithelial cell-conditioned monocyte-derive dendritic cells

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

人气道上皮细胞条件化单核细胞衍生树突状细胞的转录谱分析

E-GEOD-12773 是一项收录于 EBI Expression Atlas 的差异表达实验数据集,物种为 Homo sapiens,研究内容为人气道上皮细胞条件化单核细胞衍生树突状细胞的转录谱分析。该数据集在本站归入呼吸道疾病 / 其他分类,主题标签为 Differential,其核心价值在于从转录组层面刻画经气道上皮细胞条件化处理的单核细胞衍生树突状细胞所发生的基因表达差异。整体而言,该数据集面向呼吸道上皮与免疫细胞相互作用的表达谱研究场景,为相关差异表达分析提供公开可获取的实验数据资源。

【数据集背景】

该数据集聚焦于人气道上皮细胞与单核细胞衍生树突状细胞之间的条件化培养体系,通过转录谱分析考察后者在条件化处理下的表达变化。气道上皮细胞作为呼吸道的第一道屏障,可通过分泌可溶性因子影响局部免疫细胞的功能状态,而单核细胞衍生树突状细胞是连接固有免疫与适应性免疫的重要抗原提呈细胞。该实验以差异表达为研究主题,属于 EBI Expression Atlas 中的 Differential 类实验,说明其设计目的在于比较不同条件之间的基因表达差异,而非单纯描述某一状态的表达谱。数据集英文名称直接点明了研究对象与实验类型,即人气道上皮细胞条件化单核细胞衍生树突状细胞的转录谱分析。

【数据内容】

该数据集的内容为转录谱(transcription profiling)数据,物种为 Homo sapiens,实验类型为差异表达实验。其主题标签为 Differential,表明数据围绕条件间表达差异展开。源站描述仅给出实验名称、物种与实验类别等概要信息,未提供样本数量、分组设计、检测平台、基因数量或具体差异表达结果等细节。因此,关于数据内容的具体构成,源站未提供更进一步的说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,即 EBI Expression Atlas 实验记录,源站将其标注为 Expression Atlas experiment (Differential),物种为 Homo sapiens。数据集的英文名称与源站描述一致,均指向人气道上皮细胞条件化单核细胞衍生树突状细胞的转录谱分析。除来源站点与实验类别外,源站未提供样本采集地点、时间跨度、伦理审批信息或原始数据生成流程等细节。

【适用场景】

基于其差异表达实验的定位与呼吸道相关分类,该数据集可适用于呼吸道上皮—免疫细胞相互作用研究中的差异表达分析场景,例如比较条件化处理与对照条件下单核细胞衍生树突状细胞的转录谱变化,或作为呼吸道疾病相关表达谱研究的参考数据。其主题标签 Differential 也提示该数据适合用于差异表达结果的检索与复现类工作。由于源站未提供具体分组与结果信息,更细化的应用场景需以源站记录为准。

【使用方法】

该数据集可通过 EBI Expression Atlas 获取,用户可依据实验编号 E-GEOD-12773 在源站检索对应实验页面,查看差异表达实验的概要信息。源站未提供关于数据下载格式、分析流程、参数设置或可视化工具的具体说明,因此具体使用方法应以源站页面提供的指引为准。

【质量与限制】

该数据集由 EBI Expression Atlas 收录,属于公开表达谱实验记录,其物种与实验类别信息明确。但源站描述较为概要,未提供样本量、重复数、统计方法、差异表达阈值或验证实验等信息,因而无法据此评估数据的技术质量与结果稳健性。此外,本站分类为呼吸道疾病 / 其他,属于较宽泛的归类,具体疾病关联信息源站未提供。使用时应结合源站原始记录判断数据适用范围。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可条款信息。使用者在引用或再利用该数据集前,应查阅 EBI Expression Atlas 对应实验页面所载明的引用要求与使用条件。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-12773

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Transcription profiling of human airway epithelial cell-conditioned monocyte-derive dendritic cells

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