HIV感染中肺部恶性肿瘤的分子变化
数据覆盖 HIV 感染背景下肺部恶性病变相关的基因表达差异信息,可用于分析 HIV 感染与肺癌分子改变之间的关联,支持差异表达研究与呼吸系统疾病相关机制探索(来源 ebi.ac.uk)

基本信息
资源简介
HIV感染中肺部恶性肿瘤的分子变化
E-GEOD-106937 是一个以“HIV 感染背景下肺部恶性病变的分子改变”为主题的基因表达数据集,英文全称为 Molecular Changes of Lung Malignancy in HIV Infection。该数据集属于呼吸系统疾病分类下的其他类目,来源于 ebi.ac.uk,在源站被描述为 Expression Atlas 实验(差异型),物种为 Homo sapiens。其核心价值在于提供 HIV 感染背景下肺部恶性病变相关的基因表达差异信息,可用于分析 HIV 感染与肺癌分子改变之间的关联,支持差异表达研究与呼吸系统疾病相关机制探索。
【数据集背景】
该数据集聚焦于 HIV 感染与肺部恶性病变之间的分子层面联系。HIV 感染者的肺部并发症与恶性肿瘤风险是呼吸系统疾病研究中的重要议题,而分子层面的基因表达变化是理解这一关联的关键切入点。数据集以“HIV 感染中肺部恶性病变的分子改变”为研究主题,属于差异表达类型的实验数据,物种为人类(Homo sapiens)。源站将其归入 Expression Atlas 实验(Differential)体系,说明其设计目的是通过比较不同条件下的表达谱来识别差异表达基因。该数据集在本站被归类为呼吸系统疾病下的其他类目,主题标签为 Differential,表明其分析重点在于组间表达差异而非单纯的表达谱展示。
【数据内容】
数据集的内容围绕 HIV 感染背景下肺部恶性病变相关的基因表达差异信息展开。根据源站描述,该实验属于差异型表达分析,物种为人类。数据可用于分析 HIV 感染与肺癌分子改变之间的关联,支持差异表达研究以及呼吸系统疾病相关机制的探索。主题标签“Differential”进一步明确了数据的差异分析属性。关于具体的样本数量、基因数量、分组设计、表达值类型、注释信息等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ebi.ac.uk,即欧洲生物信息研究所(EBI)的公开数据资源。源站将其描述为 Expression Atlas 实验(Differential),物种为 Homo sapiens。数据集的英文名称直接体现了其研究主题:HIV 感染中肺部恶性病变的分子改变。除来源站与源站描述外,关于样本采集地点、采集时间、实验平台、测序或芯片技术细节等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于以下方向:一是 HIV 感染与肺癌分子改变之间关联的分析研究;二是差异表达研究,利用组间比较识别与 HIV 感染背景下肺部恶性病变相关的差异表达基因;三是呼吸系统疾病相关机制的探索,为理解 HIV 感染如何影响肺部恶性病变的分子过程提供数据支持。由于数据主题标签为 Differential,其典型用途包括差异表达分析、候选基因筛选以及分子机制假设的生成。关于该数据集是否适用于临床诊断、预后预测或其他特定应用,源站未提供。
【使用方法】
该数据集为 Expression Atlas 实验(Differential)类型,使用者可按照差异表达分析的常规流程进行探索,例如比较不同实验条件下的基因表达水平、识别差异表达基因并进行功能层面的解读。由于数据集来源于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas 体系,使用者可通过该来源站获取数据。关于具体的下载方式、文件格式、分析工具推荐、参数设置等操作细节,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 ebi.ac.uk 的 Expression Atlas 实验体系,具备公开数据资源的基本来源保障。其主题标签为 Differential,物种为 Homo sapiens,研究主题明确。然而,关于样本量、统计功效、批次效应、数据完整性、质控指标等质量相关信息,源站未提供。使用者应注意,该数据集聚焦于 HIV 感染背景下肺部恶性病变的分子改变,其结论的适用范围应结合具体实验设计加以判断,而实验设计的详细内容源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集时,应参考来源站 ebi.ac.uk 的相关规定。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/gxa/experiments/E-GEOD-106937
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Expression Atlas experiment (Differential). Species: Homo sapiens. Molecular Changes of Lung Malignancy in HIV Infection
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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