预适应寄生噬菌体对病原体的数据：提高铜绿假单胞菌囊性纤维化分离株的清除并降低抗性进化

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5061/dryad.t285m

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数据集大小约 105.1 KB。

数据说明

近年来，由于抗生素耐药性的惊人上升，人们重新对噬菌体疗法——利用病毒特异性杀死致病细菌——产生了兴趣。然而，噬菌体疗法的一个主要局限是细菌易于进化出对噬菌体的抗性。在此，我们确定了体外实验共进化是否能通过限制间歇性和慢性囊性纤维化铜绿假单胞菌肺部分离株对四种不同噬菌体的抗性进化，来提高噬菌体疗法的效率。我们首先使所有噬菌体株系针对所有细菌株系进行预适应，然后比较了预适应噬菌体与未适应噬菌体对祖先细菌株系的效力。我们发现，进化后的噬菌体在降低细菌密度方面比祖先噬菌体更有效。这主要是因为只有50%的细菌株系能够进化出对进化噬菌体的抗性，而所有细菌都能对祖先噬菌体进化出一定程度的抗性。

尽管间歇性分离株和慢性分离株的耐药性进化速率并无差异，但在无噬菌体存在时，慢性分离株为此承受了相对更高的生长代价。这很可能解释了为何进化后的噬菌体在降低慢性分离株密度方面更为有效。我们的数据表明，病原体基因型对噬菌体预适应的反应各不相同，因此，噬菌体疗法可能需要针对不同患者进行个体化调整。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。