噬菌体感染和杀伤细胞内分枝杆菌脓肿
该数据集包含分枝杆菌脓肿在细胞内被噬菌体感染和杀伤的实验数据，数据模态为临床表格形式的CSV文件，记录了细菌CFU计数、噬菌体细胞内定量和感染报告等原始值，主要用于研究噬菌体疗法对细胞内耐药分枝杆菌的杀伤效果，为治疗囊性纤维化等肺部疾病的感染提供实验依据。
基本信息
资源简介
噬菌体感染和杀伤细胞内分枝杆菌脓肿
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Bacteriophage infection and killing of intracellular Mycobacterium abscessus》。
【数据内容】
源站原始描述：Mycobacterium abscessus is a nontuberculous mycobacterium (NTM) that contributes to the decline and death of patients with lung diseases such as cystic fibrosis and other muco-obstructive airway diseases. M. abscessus is challenging to treat due to its extensive antibiotic resistance and ability to survive inside mammalian cells. An alternative to antibiotics is the therapeutic use of bacteriophages (phages). There are recent cases of phage therapy being used to treat M. abscessus infections in…
【主题与分类】
主题标签：phage therapy、mycobacterium abscessus、Macrophages、Mycobacteria、Bacteriophage。
【获取与许可】
源站页面：https://search.dataone.org/view/sha256:ec225ea38da57d67d0daca71981a4cb614014fc0374109539e4aa6efb01991fa
下载信息
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使用方式
数据集获取
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集来源于一项研究分枝杆菌脓肿（一种非结核分枝杆菌）在细胞内环境中被噬菌体感染和杀伤的实验。数据集包含多个CSV文件，记录了细菌菌落形成单位（CFU）计数、噬菌体在哺乳动物细胞内的定量（如噬菌体斑点百分比）以及通过mCherry报告基因指示的噬菌体感染率等原始实验数据。这些数据通过荧光显微镜等实验方法获取，主要用于探索噬菌体疗法对细胞内分枝杆菌脓肿的潜在治疗效果，为治疗囊性纤维化等肺部疾病中的耐药感染提供研究基础。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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