表观遗传人类巨细胞病毒感染评分预测血清阳性肺移植受者病毒血症风险
该数据集来自一项关于人类巨细胞病毒（CMV）感染与实体器官移植受者病毒血症风险的表观遗传学研究，包含11个补充文件，涵盖DNA甲基化数据与分析结果
基本信息
资源简介
表观遗传人类巨细胞病毒感染评分预测血清阳性肺移植受者病毒血症风险
An epigenetic human cytomegalovirus infection score predicts viremia risk in seropositive lung transplant recipients
该数据集来自一项关于人类巨细胞病毒（CMV）感染与实体器官移植受者病毒血症风险的表观遗传学研究，包含11个补充文件，涵盖DNA甲基化数据与分析结果。研究对156名肺或肾移植前个体的DNA甲基化谱进行刻画，发现CMV阳性受者甲基化组在神经发育及Polycomb群蛋白结合位点呈高甲基化、在淋巴细胞成熟关键区域呈低甲基化，并构建了基于机器学习的评分模型用于预测病毒血症风险。数据可用于CMV感染表观遗传机制研究及移植后风险预测模型开发（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《An epigenetic human cytomegalovirus infection score predicts viremia risk in seropositive lung transplant recipients》发表于 Epigenetics（2024），DOI：10.1080/15592294.2024.2408843。项目资助方：The work was supported by the United States Department of Veterans Affairs [JRG].。源站首次发布：2024-10-03。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：实体器官移植（SOT）受者中的巨细胞病毒（CMV）感染和再激活会增加病毒血症、移植物失功和死亡的风险。CMV血清状态的临床研究表明，供者阳性受者阴性（D+/R−）患者的病毒血症风险高于D−/R−。大多数患者为R+，具有中等血清学风险。为了刻画CMV感染的长期影响并评估病毒血症风险，我们试图测量CMV对受者免疫表观基因组的影响。具体而言，我们在肺或肾移植前对156名个体的DNA甲基化进行了分析。我们发现，CMV阳性SOT受者的甲基化组在与神经发育和Polycomb群（PcG）蛋白结合相关的位点呈高甲基化，而在对淋巴细胞成熟至关重要的区域呈低甲基化。此外，我们开发了一个基于机器学习的模型 t
【数据结构与技术规格】
文件数 11 个，合计 5.87 MB。数据集 DOI：10.6084/m9.figshare.27160482.v1。
【主题与分类】
源站学科分类：Medicine、Molecular Biology、Pharmacology、Biotechnology、Immunology、Developmental Biology。主题标签：Cytomegalovirus、DNA methylation、epigenetics、kidney transplantation、lung transplantation、biomarker。本站分类：呼吸系统疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medicine、Molecular Biology、Pharmacology、Biotechnology、Immunology、Developmental Biology。
【获取与许可】
源站页面：https://tandf.figshare.com/articles/dataset/An_epigenetic_human_cytomegalovirus_infection_score_predicts_viremia_risk_in_seropositive_lung_transplant_recipients/27160482
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：An epigenetic human cytomegalovirus infection score predicts viremia risk in seropositive lung transplant recipients. Taylor & Francis. Hsu, Fei-Man; Mohanty, Rashmi P.; Rubbi, Liudmilla; Thompson, Michael; Pickering, Harry; Reed, Elaine F.; et al
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源站：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.27160482.v1
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 5.9 MB。
数据说明
巨细胞病毒（CMV）感染及再激活在实体器官移植（SOT）受者中会增加病毒血症、移植物失功和死亡的风险。CMV血清状态的临床研究表明，供者阳性/受者阴性（D+/R−）患者的病毒血症风险高于D−/R−。大多数患者为R+，具有中等血清学风险。为了描述CMV感染的长期影响并评估病毒血症风险，我们试图测量CMV对受者免疫表观基因组的影响。具体而言，我们在156例肺或肾移植前个体中分析了DNA甲基化。我们发现，CMV阳性SOT受者的甲基化组在与神经发育和Polycomb group（PcG）蛋白结合相关的位点呈高甲基化，而在对淋巴细胞成熟至关重要的区域呈低甲基化。此外，我们开发了一种基于机器学习的模型，在校正细胞类型组成和 ancestry 后预测受者的CMV血清状态。
在肺移植队列中，基线时在R+个体中测得的CMV表观遗传评分能准确分层病毒血症风险，并且与血清状态一起，CMV表观遗传评分可能成为识别高病毒血症风险R+患者的潜在生物标志物。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
