数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Ad282b4bb0fc73e242311e9ba0a4346657e63ef07fdec14bb9105b2285a043cc9

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们运用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和低起始量全基因组测序（WGS）技术，探究了暴露于致癌物气道中的上皮变化，并追踪了克隆演化轨迹。本数据集包括：包含经NTCU处理及对照组小鼠气管细胞处理后scRNA-seq数据的Seurat对象；包含从NTCU处理及对照组小鼠气管样本中分离出的上皮亚群细胞数据的Seurat对象；包含来自当前吸烟者与非吸烟者个体的人气管上皮细胞整合数据的Seurat对象。这些数据跨越多个数据集，并已针对下游分析进行了统一处理。此外，还包括在WGS分析中鉴定出的小鼠克隆中检测到的注释替换、双碱基替换及插入缺失列表。

异常基底细胞克隆动态塑造早期肺癌发生

我们已提交本研究中经过处理的**单细胞RNA测序（scRNA-seq）和全基因组测序（WGS）**数据，包括Seurat对象、注释的变异调用结果以及详细的元数据，以供进一步分析：异常基底细胞克隆动态塑造早期肺癌发生。

描述

NTCU_GEX_Trachea_processed_Celltype_seurat.rds

该Seurat对象包含来自NTCU处理组和对照组小鼠气管细胞的经过处理的单细胞RNA测序数据。数据包含多种细胞类型的注释，可用于分析基因表达谱和细胞异质性。

• 元数据列：
• orig.ident：样本的原始标识符
• nCount_originalexp：每个细胞的总RNA计数
• nFeature_originalexp：每个细胞检测到的特征数量
• sample：样本标识符
• …

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。