机会性真菌感染发生率的前瞻性观察性研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05707156

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：耶氏肺孢子菌感染、肺孢子菌、隐球菌病、念珠菌病、曲霉病。研究者将使用TriNetX，这是一个全球联合研究网络，从66家医疗机构的电子病历（EMRs）中捕获匿名数据。研究者正在建立一项前瞻性观察研究，对象是正在接受全身性（口服或静脉）皮质类固醇治疗超过2周的非HIV、非移植（NHNT）患者。研究者计划排除年龄小于18岁且有隐球菌病、曲霉病、耶氏肺孢子菌肺炎或侵袭性念珠菌病既往史的个体。研究者将根据每日累积泼尼松等效剂量（mg）对3个队列进行随访。第1组：每天0-10 mg，第2组：每天10-20 mg，第3组：每天>20 mg。研究者将根据ICD-10代码或实验室结果，每隔3-6个月记录隐球菌病、曲霉病、耶氏肺孢子菌肺炎或侵袭性念珠菌病的任何发生情况。

研究人员还将记录患者的其他临床特征，包括人口统计学信息、合并症、用药情况以及有限的实验室检查结果。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。