真菌性肺炎评估与可能性预测评分的推导与验证

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07681583

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数据说明

疾病：肺炎、真菌性肺炎、曲霉病性肺炎、肺曲霉病、侵袭性肺曲霉病、肺孢子菌、肺孢子菌肺炎、真菌性疾病。真菌性肺炎作为严重呼吸道感染的病因日益受到重视，并伴有较高的发病率和死亡率。早期诊断仍具挑战性，因为临床表现常无特异性，且传统诊断标准在急诊环境中可能难以直接适用。识别延迟可能导致诊断检查延迟及靶向抗真菌治疗的启动延迟。FUNGAL-P研究是一项非营利性、单中心观察性研究，在Careggi大学医院（意大利佛罗伦萨）开展。该研究旨在推导并验证一项临床预测规则，用于早期识别表现为肺炎的成年患者中的真菌性肺炎或真菌-细菌混合感染。该研究包括两个连续阶段。回顾性推导阶段：推导队列包括2022年1月1日至2023年12月31日期间诊断的微生物学确诊肺炎的成年患者。

符合条件的患者在就诊后48小时内接受了支气管肺泡灌洗（BAL）、支气管吸引物或气管内吸引物的采集。微生物学检查包括真菌和细菌培养、半乳甘露聚糖检测、曲霉属和耶氏肺孢子菌的分子检测，以及多重分子呼吸道病原体检测。经微生物学确诊为真菌性肺炎的患者构成研究组，而细菌性或病毒性肺炎患者作为对照组。真菌-细菌混合感染病例归类为真菌性肺炎。未通过微生物学鉴定出病原体的患者被排除。前瞻性验证阶段 验证队列包括2024年1月1日至2024年12月31日期间连续入组的成年肺炎患者。患者按照标准临床实践接受了常规微生物学检查。对推导出的FUNGAL-P评分的性能进行了评估 p

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。