靶向PTX3的抗真菌预防

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT03828773

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

疾病：念珠菌病、真菌感染、急性髓系白血病、遗传易感性、曲霉病。背景：侵袭性霉菌感染（IMI，包括由曲霉属 spp [IA] 和非曲霉属霉菌引起的感染）是血液病患者的主要关注点，例如患有急性髓系白血病（AML）或转化中的骨髓增生异常综合征（MDSit）的患者，本方案中统称为 AML/MDSit，或接受造血细胞移植（HCT）的患者，其发病率和死亡率分别在 3-15% 和 25-45% 之间。原发性抗真菌预防已成为此类患者的标准治疗。历史上，氟康唑（对 IA 无活性）被用作预防，并显著减少了侵袭性念珠菌病（IC）。最近，泊沙康唑（一种广谱唑类，对 IA 和其他非曲霉属丝状霉菌有活性）被批准用于高风险患者类别的原发性抗真菌预防。然而，基于 IMI 的相对低发病率和需要治疗的大量患者，普遍使用泊沙康唑进行预防受到了挑战。

此外，广谱唑类药物的使用费用高昂，且与大量并发症相关。因此，亟需通过识别IMI风险最高的患者来接受广谱唑类药物治疗，从而优化抗真菌预防策略。Pentraxin-3（PTX3）是一种模式识别受体，能够识别并结合曲霉菌分生孢子，促进调理作用，进而激活补体和吞噬细胞。在人类研究中，已发现编码PTX3基因中的两个单核苷酸多态性（SNPs）是IA和/或IMI的强预测因子。PTX3 SNPs在临床实践中之所以不同且重要，原因在于：（i）关于PTX3与IA的基础科学数据具有广泛性和可重复性，（ii）PTX3 SNPs与IA的关联已在许多不同患者群体中得到验证，以及（iii）次要等位基因在普通人群中频率较高。研究者假设

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。