CPTAC 临床蛋白组学肿瘤分析联盟-AML队列
CPTAC-AML 属于美国临床蛋白组学肿瘤分析联盟开展的肿瘤学重大子项目。该数据集除了提供常规的全外显子和转录组测序数据外，核心优势在于包含了基于高端质谱技术产生的高质量全蛋白质组和磷酸化蛋白质组学量化分析数据。这种“蛋白质-基因组学”多维度层面的深度整合，能深刻揭示急性髓系白血病发病中的信号通路激活状态及小分子药物靶向位点。
基本信息
模态
多模态
任务类型
分类
许可
CC BY 3.0
创建/更新时间
2022-01-01
资源简介
CPTAC项目下的AML分支，提供了患者多维度组学数据，强调在蛋白质组学和修饰组学层面探索急性白血病发病机理。
下载信息
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使用方式
数据集获取（TCIA 标准方式）
方式一：NBIA 搜索
- 打开 NBIA 搜索页（免费注册 TCIA 账号）；
- 按本数据集 Collection 名称筛选（见源站页面），加入 Download Basket；
- 用 NBIA Download Manager 批量下载 DICOM。
方式二：NBIA API（程序化）
curl -s "https://services.cancerimagingarchive.net/nbia-api/services/v1/getSeries?Collection=COLLECTION_NAME" -o series.json
方式三：TCIA Manifest + dicomsort
在 Collection 页面下载 .tcia manifest 文件后用 NBIA CLI 下载。
数据说明
CPTAC项目下的AML分支，提供了患者多维度组学数据，强调在蛋白质组学和修饰组学层面探索急性白血病发病机理。
数据加载示例（DICOM 影像）
import pydicom, glob, os
files = glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.dcm"), recursive=True)
d = pydicom.dcmread(files[0])
print("Modality:", d.Modality)
img = d.pixel_array
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