Acinetobacter baumannii 对过氧化氢的转录响应及 mumR 和 oxyR 的调控作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE114130

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数据说明

鲍曼不动杆菌是一种革兰氏阴性机会致病菌，可引起多种感染，包括肺炎、菌血症和伤口感染。由于存在多种内在性和获得性耐药机制，鲍曼不动杆菌分离株通常为多重耐药，且感染以难以治疗而著称。因此，鉴定鲍曼不动杆菌在感染过程中赖以存活以应对各种应激的机制，对于发现新的药物靶点具有重要意义。在本研究中，我们利用RNA测序技术测定了鲍曼不动杆菌对过氧化氢应激的转录反应。暴露于过氧化氢后，鲍曼不动杆菌有数百个基因发生差异转录。在本研究中，我们还测定了转录调控因子mumR或oxyR基因被遗传失活的鲍曼不动杆菌菌株的转录谱，并鉴定了这些菌株与野生型鲍曼不动杆菌在应对过氧化氢应激时的转录差异。通过上述研究，明确了鲍曼不动杆菌OxyR在过氧化氢应激抗性以及调控过氧化氢解毒所需基因方面的功能。

此外，还探讨了未表征的调节因子MumR对过氧化氢胁迫抗性的贡献。本研究揭示了重要人类病原体在过氧化氢胁迫条件下的转录组。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。