硝酸镓抗血流感染鲍曼不动杆菌转录组分析

该数据集来自 NCBI GEO(GSE194255),包含针对血流感染来源的鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)的转录组学分析数据,用于探究硝酸镓[Ga(NO3)3]的抗菌作用及其分子机制

geo
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基因组分类GPL19644470
GSE194255: Transcriptomics analysis reveals the molecular mechanisms of the  antibacterial activity of gallium nitrate against Acinetobacter baumannii isolated from bloodstream infections

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

硝酸镓抗血流感染鲍曼不动杆菌转录组分析

Transcriptomics analysis reveals the molecular mechanisms of the antibacterial activity of gallium nitrate against Acinetobacter baumannii isolated from bloodstream infections

该数据集来自 NCBI GEO(GSE194255),包含针对血流感染来源的鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)的转录组学分析数据,用于探究硝酸镓[Ga(NO3)3]的抗菌作用及其分子机制。数据以高通量测序表达谱形式提供,共 1 个文件(GSE194255_series_matrix.txt.gz),平台为 GPL19644。该数据可用于分析硝酸镓处理前后细菌基因表达变化,识别差异表达基因及相关通路,从而辅助研究其抗菌分子机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 24 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:本研究旨在探究硝酸镓[Ga(NO 3 ) 3 ]对血流感染来源的鲍曼不动杆菌的抗菌作用及其分子机制。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL19644、470。本站分类:感染性疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE194255

【使用注意】

· 源站最后修改于 Apr 23 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的:本研究旨在探讨硝酸镓[Ga(NO3)3]对血流感染来源鲍曼不动杆菌的抗菌作用及其分子机制。方法:共分离自血流感染的40株具有不同抗菌药物敏感性模式的鲍曼不动杆菌。采用微量稀释法和时间-杀菌曲线分析Ga(NO3)3的体外抗菌作用。评估氯化铁/血红素对Ga(NO3)3抗菌作用的影响。进行转录组测序以阐明硝酸镓的抗菌机制。构建小鼠感染模型以探讨硝酸镓的体内疗效。结果:Ga(NO3)3在含10%人血清的RPMI 1640培养基中表现出优异的抗菌作用(MIC范围为0.06 μg/mL至0.125 μg/mL),而外源性氯化铁/血红素可削弱其抗菌作用。Ga(NO3)3以剂量和时间依赖性方式抑制鲍曼不动杆菌生长。

Ga(NO3)3通过上调与铁载体生物合成和转运相关基因的表达,并破坏多个铁依赖性代谢过程而发挥抗菌作用。Ga(NO3)3显著降低了中性粒细胞减少小鼠大腿感染模型中的细菌载量。结论:本研究表明,Ga(NO3)3在体内和体外均具有优异的抗菌活性,可能成为治疗鲍曼不动杆菌血流感染的潜在药物。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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