澳大利亚生物平台:抗生素耐药脓毒症病原体框架计划(肺炎链球菌检测)
该数据集来自 Bioplatforms Australia 的抗生素耐药脓毒症病原体框架计划,聚焦 Streptococcus pneumoniae 的代谢组学检测,包含 GC-MS 与 LC-MS 检测数据

基本信息
资源简介
澳大利亚生物平台:抗生素耐药脓毒症病原体框架计划(肺炎链球菌检测)
Bioplatforms Australia 的抗生素耐药脓毒症病原体框架计划旨在通过基因组学、转录组学、代谢组学和蛋白质组学技术的整合应用,为五种脓毒症病原体(每种各五株菌株)构建一个框架数据集。该计划纳入的病原体包括大肠杆菌、肺炎克雷伯菌复合群、金黄色葡萄球菌、化脓性链球菌和肺炎链球菌。本次提交的数据专门针对肺炎链球菌,属于呼吸系统疾病/肺炎分类下的代谢组学数据集,包含气相色谱-质谱联用(GC-MS)与液相色谱-质谱联用(LC-MS)的肺炎链球菌检测数据,主题标签为代谢组学。
【数据集背景】
抗生素耐药脓毒症是临床面临的严峻挑战之一,而肺炎链球菌作为该框架计划纳入的五种脓毒症病原体之一,其代谢层面的特征对于理解耐药机制和致病过程具有重要意义。抗生素耐药脓毒症病原体框架计划的总体目标,是通过整合基因组、转录组、代谢组和蛋白质组等多组学技术,为五种脓毒症病原体各五株菌株建立框架数据集。本数据集是该总体计划中专门针对肺炎链球菌的组成部分,聚焦于该病原体的代谢组学检测。
【数据内容】
本数据集的核心内容是肺炎链球菌的代谢组学检测数据,具体包括 GC-MS 和 LC-MS 两类检测所获得的数据。作为抗生素耐药脓毒症病原体框架计划的一部分,该提交专门针对肺炎链球菌这一病原体。同一计划下的其他病原体检测数据分别记录于不同的研究中:大肠杆菌的 GC-MS 和 LC-MS 检测数据记录于 MTBLS2015,金黄色葡萄球菌的 GC-MS 和 LC-MS 检测数据记录于 MTBLS1898,肺炎克雷伯菌的 GC-MS 和 LC-MS 检测数据记录于 MTBLS2322,化脓性链球菌的 GC-MS 和 LC-MS 检测数据记录于 MTBLS2324,而肺炎链球菌的 GC-MS 和 LC-MS 检测数据则记录于 MTBLS2323。本数据集的主题标签为代谢组学。
【采集与来源】
本数据集来源于 omicsdi.org。其所属的抗生素耐药脓毒症病原体框架计划由 Bioplatforms Australia 发起。该计划采用基因组学、转录组学、代谢组学和蛋白质组学技术的整合应用策略。就本数据集而言,涉及的检测技术为 GC-MS 和 LC-MS。关于样本采集的具体地点、时间、菌株来源、培养条件、仪器型号、色谱与质谱参数等详细信息,源站未提供。
【适用场景】
本数据集适用于代谢组学相关的研究与分析场景,尤其是针对肺炎链球菌的代谢特征研究。由于该数据集属于抗生素耐药脓毒症病原体框架计划的一部分,其潜在应用方向包括与同一计划中其他病原体代谢组学数据的比较分析,以及与基因组、转录组、蛋白质组等多组学数据的整合研究。此外,该数据集可用于呼吸系统疾病/肺炎领域的基础研究。关于具体的适用场景说明,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供关于本数据集使用方法的说明,包括但不限于数据下载方式、文件格式、数据处理流程、分析工具建议等。
【质量与限制】
源站未提供关于本数据集质量评估与使用限制的说明,包括但不限于数据完整性、样本量、技术重复、定量准确性、批次效应以及使用条款等方面的信息。
【引用与许可】
源站未提供关于本数据集引用方式与许可条款的说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS2323
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
抗生素耐药性脓毒症病原体框架计划旨在利用基因组学、转录组学、代谢组学和蛋白质组学技术的综合应用,开发一个包含5种脓毒症病原体(每种5株菌株)的框架数据集。该计划纳入的病原体包括:大肠杆菌、肺炎克雷伯菌复合群、金黄色葡萄球菌、化脓性链球菌和肺炎链球菌。本提交内容专门针对肺炎链球菌。本研究中报告了肺炎链球菌的GC-MS和LC-MS检测结果 MTBLS2323 大肠杆菌的GC-MS和LC-MS检测结果报告于MTBLS2015 金黄色葡萄球菌的GC-MS和LC-MS检测结果报告于MTBLS1898 肺炎克雷伯菌的GC-MS和LC-MS检测结果报告于MTBLS2322 化脓性链球菌的GC-MS和LC-MS检测结果报告于MTBLS2324
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