澳大利亚生物平台:抗生素耐药脓毒症病原体框架计划(肺炎克雷伯菌检测)

本站分类:呼吸系统疾病/肺炎。本数据集为呼吸系统疾病领域公开数据集,主题涵盖Metabolomics。本数据集为呼吸道疾病领域的基因组公开数据集,来源:omicsdi,主题涵盖Metabolomics。

omicsdi
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基因组分类Metabolomics
Bioplatforms Australia: Antibiotic Resistant Sepsis Pathogens Framework Initiative (Klebsiella pneumoniae assays)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

澳大利亚生物平台:抗生素耐药脓毒症病原体框架计划(肺炎克雷伯菌检测)

Bioplatforms Australia 的抗生素耐药脓毒症病原体框架计划(Antibiotic Resistant Sepsis Pathogens Framework Initiative)旨在通过基因组学、转录组学、代谢组学和蛋白质组学技术的整合应用,为五种脓毒症病原体(每种各五株菌株)构建一个框架性数据集。本次提交的数据集专门针对肺炎克雷伯菌复合群(Klebsiella pneumoniae complex),属于该计划的一部分,主题标签为代谢组学(Metabolomics)。该数据集在站内被归类于呼吸系统疾病/肺炎领域,来源于 omicsdi.org,为呼吸系统疾病领域的公开数据集,主题涵盖代谢组学,可供相关研究人员了解和使用。

【数据集背景】

抗生素耐药脓毒症病原体框架计划的核心目标是建立一个涵盖多种组学层面的框架数据集,以系统性地研究脓毒症相关病原体。该计划选取了五种重要的脓毒症病原体,分别是:大肠杆菌(Escherichia coli)、肺炎克雷伯菌复合群(Klebsiella pneumoniae complex)、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、化脓性链球菌(Streptococcus pyogenes)以及肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)。针对每一种病原体,计划纳入五株菌株,并综合运用基因组、转录组、代谢组和蛋白质组技术进行表征。本次提交的数据集是该计划中专门针对肺炎克雷伯菌复合群的部分,聚焦于该病原体的代谢组学分析。

【数据内容】

本数据集的内容为肺炎克雷伯菌复合群的气相色谱-质谱(GC-MS)和液相色谱-质谱(LC-MS)测定数据。作为抗生素耐药脓毒症病原体框架计划的一部分,该数据集针对肺炎克雷伯菌复合群开展代谢组学层面的检测与分析。数据集的站内分类为呼吸系统疾病/肺炎,主题标签为代谢组学,表明其内容围绕代谢物谱的测定展开。该数据集与同一计划中其他病原体的相关提交相互关联:大肠杆菌的 GC-MS 和 LC-MS 测定报告于 MTBLS2015,金黄色葡萄球菌的测定报告于 MTBLS1898,肺炎链球菌的测定报告于 MTBLS2323,化脓性链球菌的测定报告于 MTBLS2324,而肺炎克雷伯菌复合群的测定则报告于 MTBLS2322。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。数据集隶属于 Bioplatforms Australia 的抗生素耐药脓毒症病原体框架计划,具体针对肺炎克雷伯菌复合群。数据采集涉及气相色谱-质谱(GC-MS)和液相色谱-质谱(LC-MS)两种分析技术,用于获取该病原体的代谢组学数据。关于样本采集的具体地点、时间、菌株来源、培养条件、仪器型号及具体实验参数等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于呼吸系统疾病/肺炎领域的研究,尤其是与肺炎克雷伯菌复合群相关的代谢组学研究。作为抗生素耐药脓毒症病原体框架计划的组成部分,它可用于比较不同脓毒症病原体在代谢层面的特征,或作为多组学整合分析的代谢组学数据来源之一。其主题标签为代谢组学,适合需要利用 GC-MS 和 LC-MS 代谢物数据的分析场景。关于具体的适用研究类型或分析目标,源站未提供进一步说明。

【使用方法】

该数据集可通过来源站 omicsdi.org 获取。数据集与 MTBLS2322 相关联,该编号对应肺炎克雷伯菌复合群的 GC-MS 和 LC-MS 测定报告。使用者可依据该编号在相关数据存储库中查找和访问数据。关于数据的具体下载方式、文件格式、数据处理流程或分析工具等信息,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为抗生素耐药脓毒症病原体框架计划中针对肺炎克雷伯菌复合群的部分,涵盖 GC-MS 和 LC-MS 代谢组学测定。关于数据的质量控制指标、覆盖度、完整性、批次效应或技术限制等信息,源站未提供。使用者应注意,该数据集仅针对肺炎克雷伯菌复合群,不包含该计划中其他病原体的数据,其他病原体的数据分别记录于各自的提交中。

【引用与许可】

该数据集来源于 omicsdi.org,隶属于 Bioplatforms Australia 的抗生素耐药脓毒症病原体框架计划。关于具体的引用格式、许可条款或使用限制等信息,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/metabolights_dataset/MTBLS2322

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

抗生素耐药性脓毒症病原体框架计划旨在利用基因组学、转录组学、代谢组学和蛋白质组学技术的综合应用,开发一个包含5种脓毒症病原体(每种5株菌株)的框架数据集。该计划纳入的病原体包括:大肠杆菌、肺炎克雷伯菌复合群、金黄色葡萄球菌、化脓性链球菌和肺炎链球菌。本次提交专门针对肺炎克雷伯菌复合群。当前研究MTBLS2322中报告了肺炎克雷伯菌的GC-MS和LC-MS检测结果;MTBLS2015中报告了大肠杆菌的GC-MS和LC-MS检测结果;MTBLS1898中报告了金黄色葡萄球菌的GC-MS和LC-MS检测结果;MTBLS2323中报告了肺炎链球菌的GC-MS和LC-MS检测结果;MTBLS2324中报告了化脓性链球菌的GC-MS和LC-MS检测结果。

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