磷酸化人囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)与ATP/Mg及Tezacaftor(VX-661)的复合物

EMPIAR-11007 磷酸化人囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)与ATP/Mg及Tezacaftor(VX-661)的复合物 1.8 磷酸化人囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)与ATP/Mg及Tezacaftor(VX-661)的未对齐多帧显微图像

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医学影像囊性纤维化CFTRTezacaftorVX-661ATP/Mg冷冻电镜EMPIAR-11007呼吸道疾病
The complex of phosphorylated human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with ATP/Mg and Tezacaftor (VX-661)

基本信息

模态
医学影像
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

磷酸化人囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)与ATP/Mg及Tezacaftor(VX-661)的复合物

该数据集收录于以呼吸道疾病与囊性纤维化为分类主题的数据资源中,其英文名称为“The complex of phosphorylated human cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) with ATP/Mg and Tezacaftor (VX-661)”。从名称可以看出,该数据集围绕磷酸化人囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)与ATP/Mg以及Tezacaftor(VX-661)形成的复合物展开,属于结构生物学与呼吸道疾病研究交叉领域的数据资源。数据来源站为ebi.ac.uk,源站对其的描述指向EMPIAR-11007编号,并说明其内容为1.8版本的未对齐多帧显微图像。整体而言,该数据集提供了与囊性纤维化相关靶点蛋白复合物相关的原始显微成像数据,可供相关领域的研究人员进一步处理和分析。

【数据集背景】

囊性纤维化是一种与呼吸道相关的疾病,其分子基础涉及囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)的功能异常。该数据集聚焦于磷酸化人CFTR与ATP/Mg及Tezacaftor(VX-661)形成的复合物。Tezacaftor(VX-661)作为复合物组成部分出现在数据集名称中,表明该数据与CFTR调节剂相关的研究情境有关。数据集被归入呼吸道疾病/囊性纤维化分类,说明其服务于该疾病领域的结构或机制研究。关于该复合物的具体生物学功能、调控机制及研究背景,源站未提供更多说明。

【数据内容】

根据源站描述,该数据集对应EMPIAR-11007,内容为“磷酸化人囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)与ATP/Mg及Tezacaftor(VX-661)的复合物”的1.8版本未对齐多帧显微图像。短描述进一步指出,这些数据是磷酸化人CFTR与ATP/Mg及Tezacaftor(VX-661)复合物的未对齐多帧显微图像。由此可知,数据主体为显微图像形式的原始帧数据,且处于未对齐状态。关于图像的具体数量、分辨率、像素尺寸、文件格式、数据量大小等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为ebi.ac.uk。源站描述中给出了EMPIAR-11007这一编号,并标明数据为1.8版本的未对齐多帧显微图像。关于采集设备、采集参数、实验条件、样品制备方法、采集时间、采集地点等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)相关的结构生物学研究,尤其是涉及磷酸化人CFTR与ATP/Mg及Tezacaftor(VX-661)复合物的图像处理、三维重建或结构解析工作。由于数据为未对齐多帧显微图像,其典型用途包括图像对齐、颗粒挑选、二维分类、三维重构等下游分析流程。此外,该数据也可用于与呼吸道疾病/囊性纤维化相关的机制研究或方法学比较。关于具体适用场景的更多说明,源站未提供。

【使用方法】

该数据集提供的是未对齐多帧显微图像,使用时可按照冷冻电镜或相关显微成像数据处理的一般流程进行后续操作,例如帧对齐、运动校正、颗粒挑选与三维重建等。由于数据版本标注为1.8,使用时应确认对应版本。关于具体的软件推荐、参数设置、处理步骤或配套元数据,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为未对齐多帧显微图像,意味着数据尚未经过对齐处理,使用者需要自行完成相关校正步骤。数据版本为1.8。关于图像质量、分辨率水平、信噪比、缺失情况、潜在伪影或其他质量相关指标,源站未提供。此外,该数据集仅涉及磷酸化人CFTR与ATP/Mg及Tezacaftor(VX-661)复合物这一特定对象,其结论或用途不宜直接外推到其他复合物或条件。

【引用与许可】

该数据集来源站为ebi.ac.uk,对应EMPIAR-11007。关于具体的引用格式、许可条款、使用限制或授权要求,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/EMPIAR-11007

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

EMPIAR-11007 磷酸化人囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)与ATP/Mg及Tezacaftor(VX-661)的复合物 1.8 磷酸化人囊性纤维化跨膜传导调节因子(CFTR)与ATP/Mg及Tezacaftor(VX-661)的未对齐多帧显微图像

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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